RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV4-1P06312 121 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 HRES1P13985 223 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS25Q9BRG1 176 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.96□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE6GP18545 87 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZQT0 140 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.92□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PPM0 123 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFB1O75438 58 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.9□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 NREPQ16612 68 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.86□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1HP80294 61 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.84□□□□□ -1.79
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R2T5 61 aa3.83□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM258P61165 79 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.81□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 BRK1Q8WUW1 75 aa3.79□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EP34 96 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO0461Q9UI25 63 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-216ENST00000590105 F8W1H4 67 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QR89 54 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINK7P58062 85 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 hDV103S1A0JD37 113 aa3.76□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 K7EQZ3 153 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 UQCRQO14949 82 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 UBL5Q9BZL1 73 aa3.75□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00846Q9NV44 126 aa3.74□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GV90 55 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ROMO1P60602 79 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.72□□□□□ -1.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ETDBQ3ZM63 59 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CASC2Q6XLA1 102 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 HCG22E2RYF7 251 aa3.69□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.68□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 K7ERU9 68 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ACYP1P07311 99 aa3.67□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.66□□□□□ -1.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.64□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 P0C880 135 aa3.63□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.62□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MT2AP02795 61 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-10P60014 251 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.58□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1FP04733 61 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00643Q86TS7 51 aa3.56□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 Q1T7F1 81 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 USH2AO75445 5202 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE3AQ5TA76 89 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CSAG1Q6PB30 78 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.51□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ATOX1O00244 68 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NN06 94 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 S4R3F8 94 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WVE0 104 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 H0Y9P7 68 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP12-2P59991 146 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SSPOA2VEC9 5147 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00208Q96KT6 92 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFC1O43677 76 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KLKP1Q107X0 134 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 COX7CP15954 63 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 COA5Q86WW8 74 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CRIPTQ9P021 101 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YAA0 97 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 MT-ATP8P03928 68 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 Q5VV11 94 aa3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC179H3BU77 68 aa3.32□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.31□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1BP07438 61 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms