RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 A8MUN3 132 aa7.24□□□□□ -1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 TSTD3H0UI37 97 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC40-211ENST00000574099 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 H3BT86 120 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCDC40-211ENST00000574099 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.16□□□□□ -1.26
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CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.21□□□□□ -1.42
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CCDC40-211ENST00000574099 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP12-1P59990 96 aa5.83□□□□□ -1.48
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CCDC40-211ENST00000574099 SNURFQ9Y675 71 aa5.78□□□□□ -1.48
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP12-4P60329 112 aa5.77□□□□□ -1.49
CCDC40-211ENST00000574099 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.74□□□□□ -1.49
CCDC40-211ENST00000574099 SEC61GP60059 68 aa5.73□□□□□ -1.49
CCDC40-211ENST00000574099 TNP1P09430 55 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC40-211ENST00000574099 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.7□□□□□ -1.5
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1B0GU33 70 aa5.69□□□□□ -1.5
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