RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.2□□□□□ -1.9
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TMOD3-209ENST00000561136 COA5Q86WW8 74 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-209ENST00000561136 IGFL1Q6UW32 110 aa2.74□□□□□ -1.97
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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