RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551219.5

PTPRR-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRR, Length 2,966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-211ENST00000551219 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRR-211ENST00000551219 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRR-211ENST00000551219 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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PTPRR-211ENST00000551219 INE1O15225 51 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRR-211ENST00000551219 LCE1DQ5T752 114 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRR-211ENST00000551219 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRR-211ENST00000551219 KRTAP10-5P60370 271 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRR-211ENST00000551219 KRTAP10-12P60413 245 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRR-211ENST00000551219 MT1XP80297 61 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRR-211ENST00000551219 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.62□□□□□ -1.99
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