RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRB-208ENST00000550358 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-208ENST00000550358 COL7A1Q02388 2944 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRB-208ENST00000550358 MT1LQ93083 61 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.84□□□□□ -1.96
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PTPRB-208ENST00000550358 MT1EP04732 61 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRB-208ENST00000550358 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRB-208ENST00000550358 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRB-208ENST00000550358 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
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