RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A087WVE0 104 aa3.7□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 CXCL6P80162 114 aa3.7□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.7□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 KMT2DO14686 5537 aa3.69□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.69□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.69□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFAF8A1L188 74 aa3.68□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATOX1O00244 68 aa3.68□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 NREPQ16612 68 aa3.68□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A087WSZ3 146 aa3.66□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC179H3BU77 68 aa3.66□□□□□ -1.82
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q96NJ1 140 aa3.66□□□□□ -1.82
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MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV4-1P06312 121 aa3.65□□□□□ -1.83
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MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.63□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 SERP2Q8N6R1 65 aa3.63□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q8N9L7 120 aa3.63□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.63□□□□□ -1.83
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MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE3AQ5TA76 89 aa3.62□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 A8MUU9 505 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 K7EQZ3 153 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRAC1Q96KF2 57 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.59□□□□□ -1.83
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MSC-AS1-202ENST00000512290 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 OCR1Q9BZK8 76 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 A8MWP4 228 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 HCG22E2RYF7 251 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00313P59037 77 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP12-2P59991 146 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR15Q8IV56 129 aa3.55□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 C20orf197Q8N268 126 aa3.55□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.55□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 A6NN06 94 aa3.54□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.53□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.53□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GVX0 72 aa3.53□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 KLKP1Q107X0 134 aa3.53□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.53□□□□□ -1.84
MSC-AS1-202ENST00000512290 C8orf87E5RJ46 101 aa3.52□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFB1O75438 58 aa3.52□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM258P61165 79 aa3.51□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 CASC2Q6XLA1 102 aa3.51□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.51□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 SNURFQ9Y675 71 aa3.51□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 H7BZZ5 65 aa3.5□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.5□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFC1O43677 76 aa3.49□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 hDV103S1A0JD37 113 aa3.48□□□□□ -1.85
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MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.48□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 C5orf47Q569G3 176 aa3.47□□□□□ -1.85
MSC-AS1-202ENST00000512290 H0Y9P7 68 aa3.45□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 H3BPC8 53 aa3.45□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 MP68P56378 58 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.44□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 A8MU10 97 aa3.43□□□□□ -1.86
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR2BP35325 72 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR2AP35326 72 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPINK7P58062 85 aa3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00208Q96KT6 92 aa3.42□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFS5O43920 106 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.41□□□□□ -1.86
MSC-AS1-202ENST00000512290 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.4□□□□□ -1.87
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.39□□□□□ -1.87
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q5W150 140 aa3.38□□□□□ -1.87
MSC-AS1-202ENST00000512290 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.38□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.37□□□□□ -1.87
MSC-AS1-202ENST00000512290 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.36□□□□□ -1.87
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SPRR2DP22532 72 aa3.33□□□□□ -1.88
MSC-AS1-202ENST00000512290 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.33□□□□□ -1.88
MSC-AS1-202ENST00000512290 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.3□□□□□ -1.88
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1BP07438 61 aa3.28□□□□□ -1.88
MSC-AS1-202ENST00000512290 COA5Q86WW8 74 aa3.27□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 C4orf26Q17RF5 130 aa3.26□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 DMAC1Q96GE9 116 aa3.25□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q1T7F1 81 aa3.24□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.24□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 ACYP2P14621 99 aa3.22□□□□□ -1.89
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.21□□□□□ -1.9
MSC-AS1-202ENST00000512290 V9GYY9 64 aa3.21□□□□□ -1.9
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