RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.23□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 ZANQ9Y493 2812 aa0.23□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.23□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 AKAP9Q99996 3911 aa0.22□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 SPRR2AP35326 72 aa0.22□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 ITPR1Q14643 2758 aa0.22□□□□□ -2.37
NELFCD-210ENST00000490205 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 CUBNO60494 3623 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.21□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 MT1AP04731 61 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 PRCDQ00LT1 54 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.2□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 CEP250Q9BV73 2442 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LAMA5O15230 3695 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 MGAQ8IWI9 3026 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.19□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 TRIOO75962 3097 aa0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LAMA1P25391 3075 aa0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 CFAP54Q96N23 3096 aa0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.18□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 K7EIM0 57 aa0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPRR2EP22531 72 aa0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LAMA3Q16787 3333 aa0.17□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 LRP2P98164 4655 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 C5orf42Q9H799 3197 aa0.16□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 ATMQ13315 3056 aa0.15□□□□□ -2.38
NELFCD-210ENST00000490205 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.15□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa0.15□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.15□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 RELNP78509 3460 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 LRBAP50851 2863 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 H3BSH0 61 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.14□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 FAT1Q14517 4588 aa0.13□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.12□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 FRYLO94915 3013 aa0.12□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 ITPR2Q14571 2701 aa0.12□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.12□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.11□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.11□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 HERC1Q15751 4861 aa0.11□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 H3BUX3 64 aa0.1□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB1P60022 68 aa0.1□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.1□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.1□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 MYO9AB2RTY4 2548 aa0.1□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.09□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.09□□□□□ -2.39
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB136Q30KP8 78 aa0.09□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.09□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 SSPOA2VEC9 5147 aa0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MT1HP80294 61 aa0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 RPL39P5Q59GN2 51 aa0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB124Q8NES8 71 aa0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MUC3AQ02505 3323 aa0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MUC17Q685J3 4493 aa0.07□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MUC2Q02817 5179 aa0.07□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.07□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.06□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.06□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 MT1EP04732 61 aa0.06□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.06□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 VPS13CQ709C8 3753 aa0.05□□□□□ -2.4
NELFCD-210ENST00000490205 A0A096LNI7 61 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms