RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.76□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANK2Q01484 3957 aa7.76□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.76□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.74□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.73□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.7□□□□□ -1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.68□□□□□ -1.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.63□□□□□ -1.19
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH2Q9P225 4427 aa7.55□□□□□ -1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.52□□□□□ -1.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.51□□□□□ -1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAT1Q14517 4588 aa7.48□□□□□ -1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT2AQ03164 3969 aa7.45□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.44□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.38□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INE1O15225 51 aa7.38□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.36□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.3□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RYR1P21817 5038 aa7.27□□□□□ -1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.23□□□□□ -1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.21□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.2□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYSTQ99698 3801 aa7.19□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-12P60413 245 aa7.19□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.17□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.14□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RYR3Q15413 4870 aa7.13□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.11□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYCBP2O75592 4640 aa7.1□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RYR2Q92736 4967 aa7.09□□□□□ -1.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.08□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.06□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP12-3P60328 96 aa7.05□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE3AQ5TA76 89 aa7.04□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.04□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.99□□□□□ -1.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.88□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKHD1P08F94 4074 aa6.87□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.84□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1HP80294 61 aa6.81□□□□□ -1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKD1P98161 4303 aa6.79□□□□□ -1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPG2P98160 4391 aa6.78□□□□□ -1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERC2O95714 4834 aa6.76□□□□□ -1.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT2AP02795 61 aa6.69□□□□□ -1.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.65□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1FP04733 61 aa6.61□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP2P98164 4655 aa6.59□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.59□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-5P60370 271 aa6.54□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.42□□□□□ -1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNXBP22105 4242 aa6.4□□□□□ -1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERC1Q15751 4861 aa6.4□□□□□ -1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE2CQ5TA81 110 aa6.35□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.34□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPAP08519 4548 aa6.34□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.33□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.31□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.3□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.25□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.22□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.2□□□□□ -1.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.17□□□□□ -1.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1BP07438 61 aa6.12□□□□□ -1.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC17Q685J3 4493 aa6.09□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1XP80297 61 aa6.08□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.07□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.98□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.98□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.98□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF213Q63HN8 5207 aa5.9□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.87□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.85□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.84□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.84□□□□□ -1.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE2BO14633 110 aa5.82□□□□□ -1.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1GP13640 62 aa5.79□□□□□ -1.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE3BQ5TA77 95 aa5.75□□□□□ -1.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.74□□□□□ -1.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.67□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR2EP22531 72 aa5.67□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR2BP35325 72 aa5.67□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR2AP35326 72 aa5.67□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.65□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP12-4P60329 112 aa5.63□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC2Q02817 5179 aa5.63□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.49□□□□□ -1.53
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