RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.66□□□□□ -1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.61□□□□□ -1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-12P60413 245 aa7.6□□□□□ -1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.57□□□□□ -1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.5□□□□□ -1.21
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.44□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP12-3P60328 96 aa7.44□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.42□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE3AQ5TA76 89 aa7.4□□□□□ -1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.4□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.39□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANK2Q01484 3957 aa7.35□□□□□ -1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.33□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.33□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.28□□□□□ -1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAT1Q14517 4588 aa7.21□□□□□ -1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH2Q9P225 4427 aa7.18□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.17□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.16□□□□□ -1.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.15□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RYR1P21817 5038 aa7.15□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KMT2AQ03164 3969 aa7.12□□□□□ -1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.05□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-5P60370 271 aa7.04□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.03□□□□□ -1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1HP80294 61 aa6.99□□□□□ -1.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.96□□□□□ -1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.95□□□□□ -1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYSTQ99698 3801 aa6.92□□□□□ -1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RYR3Q15413 4870 aa6.9□□□□□ -1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.9□□□□□ -1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.9□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.9□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.85□□□□□ -1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT2AP02795 61 aa6.82□□□□□ -1.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RYR2Q92736 4967 aa6.77□□□□□ -1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.74□□□□□ -1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1FP04733 61 aa6.7□□□□□ -1.34
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.66□□□□□ -1.34
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.65□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.65□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYCBP2O75592 4640 aa6.64□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.63□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.59□□□□□ -1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.57□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERC2O95714 4834 aa6.57□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.57□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPG2P98160 4391 aa6.56□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.53□□□□□ -1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKHD1P08F94 4074 aa6.46□□□□□ -1.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.41□□□□□ -1.38
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKD1P98161 4303 aa6.33□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.3□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP2P98164 4655 aa6.29□□□□□ -1.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.24□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE2CQ5TA81 110 aa6.24□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERC1Q15751 4861 aa6.24□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.24□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.23□□□□□ -1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.21□□□□□ -1.42
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LPAP08519 4548 aa6.21□□□□□ -1.42
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.2□□□□□ -1.42
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1BP07438 61 aa6.1□□□□□ -1.43
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNXBP22105 4242 aa6.08□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.08□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1XP80297 61 aa6.07□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE3BQ5TA77 95 aa6.07□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2EP22531 72 aa6.04□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2BP35325 72 aa6.04□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2AP35326 72 aa6.04□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.02□□□□□ -1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP12-4P60329 112 aa6.02□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1GP13640 62 aa5.97□□□□□ -1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.88□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.88□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE2BO14633 110 aa5.85□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRR2DP22532 72 aa5.84□□□□□ -1.47
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.74□□□□□ -1.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC17Q685J3 4493 aa5.74□□□□□ -1.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.68□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.66□□□□□ -1.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.65□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF213Q63HN8 5207 aa5.64□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.59□□□□□ -1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.58□□□□□ -1.52
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.55□□□□□ -1.52
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