RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 IGFL1Q6UW32 110 aa1.51□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.51□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF861PO60384 105 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 FLNCQ14315 2725 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PNN7 141 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 PLAC4Q8WY50 150 aa1.5□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GU33 70 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH10OSP0CZ25 163 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 A8MU10 97 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf134Q5TEV5 83 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf163Q8N9P6 203 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV1-51P01701 117 aa1.49□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa1.48□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 A0A096LNT2 108 aa1.48□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 P0C880 135 aa1.48□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 APLNQ9ULZ1 77 aa1.48□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 MUC2Q02817 5179 aa1.48□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 ROMO1P60602 79 aa1.47□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00612Q8N6U2 182 aa1.47□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 H3BNG1 76 aa1.47□□□□□ -2.17
CCSAP-202ENST00000366686 ITPR2Q14571 2701 aa1.46□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 Q96NJ1 140 aa1.46□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JQZ4 141 aa1.46□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-11P60412 298 aa1.46□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0D9SG42 100 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 KCNQ1DNQ9H478 68 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 TENM3Q9P273 2699 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00315P59091 139 aa1.45□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa1.44□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZRX8 168 aa1.44□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf92A6NGG3 77 aa1.44□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01546A6NGU7 62 aa1.43□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 SPINK7P58062 85 aa1.43□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 DSCR10P59022 87 aa1.43□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 M0QZ58 72 aa1.43□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 RPL37P61927 97 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa1.42□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PNM2 257 aa1.41□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA8Q6RVD6 105 aa1.41□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 HIVEP1P15822 2718 aa1.41□□□□□ -2.18
CCSAP-202ENST00000366686 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 USH2AO75445 5202 aa1.4□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 CSAG1Q6PB30 78 aa1.39□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.39□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-8P60410 259 aa1.39□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.39□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 M0R2T5 61 aa1.38□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 Q5VSD8 79 aa1.38□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.38□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 PRO2289Q9P1D8 64 aa1.38□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 TNP1P09430 55 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WTM6 91 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 LCE6AA0A183 80 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 K7EIL1 84 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa1.37□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZSA8 131 aa1.36□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 TENM1Q9UKZ4 2725 aa1.36□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa1.36□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR4Q96PI1 79 aa1.35□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 R4GN34 69 aa1.35□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 CNBPP62633 177 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 TPRXLQ17RH7 258 aa1.35□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-9P26371 169 aa1.34□□□□□ -2.19
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.33□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa1.33□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00472Q9H8W2 130 aa1.33□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 PLAC8Q9NZF1 115 aa1.33□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR1BP22528 89 aa1.32□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-3P60369 221 aa1.32□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-12P60413 245 aa1.31□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 KLK9Q2XQG4 91 aa1.31□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 S4R3F8 94 aa1.29□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 TGP01266 2768 aa1.29□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GVY2 172 aa1.28□□□□□ -2.2
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR1AP35321 89 aa1.25□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-1P60331 282 aa1.25□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.25□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.24□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.22□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP12-2P59991 146 aa1.22□□□□□ -2.21
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.21□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 H0YAA0 97 aa1.21□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102 ms