RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339266.9

DLGAP4-201, Transcript of DLG associated protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DLGAP4, Length 5,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLGAP4-201ENST00000339266 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.21□□□□□ -0.94
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.19□□□□□ -0.94
DLGAP4-201ENST00000339266 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.17□□□□□ -0.94
DLGAP4-201ENST00000339266 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.14□□□□□ -0.95
DLGAP4-201ENST00000339266 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.11□□□□□ -0.95
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.07□□□□□ -0.96
DLGAP4-201ENST00000339266 FAT1Q14517 4588 aa9.03□□□□□ -0.96
DLGAP4-201ENST00000339266 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
DLGAP4-201ENST00000339266 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.95□□□□□ -0.98
DLGAP4-201ENST00000339266 ANK2Q01484 3957 aa8.95□□□□□ -0.98
DLGAP4-201ENST00000339266 KMT2AQ03164 3969 aa8.94□□□□□ -0.98
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH2Q9P225 4427 aa8.92□□□□□ -0.98
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.89□□□□□ -0.99
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.83□□□□□ -1
DLGAP4-201ENST00000339266 LYSTQ99698 3801 aa8.81□□□□□ -1
DLGAP4-201ENST00000339266 RYR1P21817 5038 aa8.78□□□□□ -1
DLGAP4-201ENST00000339266 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.75□□□□□ -1.01
DLGAP4-201ENST00000339266 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DLGAP4-201ENST00000339266 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
DLGAP4-201ENST00000339266 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.67□□□□□ -1.02
DLGAP4-201ENST00000339266 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.66□□□□□ -1.02
DLGAP4-201ENST00000339266 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.64□□□□□ -1.03
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.61□□□□□ -1.03
DLGAP4-201ENST00000339266 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.59□□□□□ -1.03
DLGAP4-201ENST00000339266 MYCBP2O75592 4640 aa8.56□□□□□ -1.04
DLGAP4-201ENST00000339266 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.55□□□□□ -1.04
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.54□□□□□ -1.04
DLGAP4-201ENST00000339266 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.53□□□□□ -1.04
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.52□□□□□ -1.05
DLGAP4-201ENST00000339266 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
DLGAP4-201ENST00000339266 RYR3Q15413 4870 aa8.47□□□□□ -1.05
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.43□□□□□ -1.06
DLGAP4-201ENST00000339266 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.43□□□□□ -1.06
DLGAP4-201ENST00000339266 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP10-12P60413 245 aa8.38□□□□□ -1.07
DLGAP4-201ENST00000339266 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.36□□□□□ -1.07
DLGAP4-201ENST00000339266 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.32□□□□□ -1.08
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE3AQ5TA76 89 aa8.25□□□□□ -1.09
DLGAP4-201ENST00000339266 RYR2Q92736 4967 aa8.24□□□□□ -1.09
DLGAP4-201ENST00000339266 PKHD1P08F94 4074 aa8.2□□□□□ -1.1
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1HP80294 61 aa8.19□□□□□ -1.1
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP12-3P60328 96 aa8.18□□□□□ -1.1
DLGAP4-201ENST00000339266 MT2AP02795 61 aa8.07□□□□□ -1.12
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.06□□□□□ -1.12
DLGAP4-201ENST00000339266 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.03□□□□□ -1.12
DLGAP4-201ENST00000339266 HERC2O95714 4834 aa8□□□□□ -1.13
DLGAP4-201ENST00000339266 LRP2P98164 4655 aa7.99□□□□□ -1.13
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1FP04733 61 aa7.97□□□□□ -1.13
DLGAP4-201ENST00000339266 HSPG2P98160 4391 aa7.97□□□□□ -1.13
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.94□□□□□ -1.14
DLGAP4-201ENST00000339266 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
DLGAP4-201ENST00000339266 PKD1P98161 4303 aa7.91□□□□□ -1.14
DLGAP4-201ENST00000339266 LPAP08519 4548 aa7.76□□□□□ -1.17
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.72□□□□□ -1.17
DLGAP4-201ENST00000339266 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.71□□□□□ -1.18
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.65□□□□□ -1.19
DLGAP4-201ENST00000339266 INE1O15225 51 aa7.59□□□□□ -1.19
DLGAP4-201ENST00000339266 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.58□□□□□ -1.2
DLGAP4-201ENST00000339266 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
DLGAP4-201ENST00000339266 TNXBP22105 4242 aa7.52□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 HERC1Q15751 4861 aa7.51□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.5□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE2CQ5TA81 110 aa7.48□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.47□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.46□□□□□ -1.21
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.43□□□□□ -1.22
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.43□□□□□ -1.22
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1BP07438 61 aa7.34□□□□□ -1.23
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1XP80297 61 aa7.34□□□□□ -1.23
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP10-5P60370 271 aa7.34□□□□□ -1.24
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.27□□□□□ -1.24
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.27□□□□□ -1.25
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.25□□□□□ -1.25
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
DLGAP4-201ENST00000339266 MUC17Q685J3 4493 aa7.18□□□□□ -1.26
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.12□□□□□ -1.27
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.12□□□□□ -1.27
DLGAP4-201ENST00000339266 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
DLGAP4-201ENST00000339266 RNF213Q63HN8 5207 aa6.99□□□□□ -1.29
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE2BO14633 110 aa6.97□□□□□ -1.29
DLGAP4-201ENST00000339266 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.96□□□□□ -1.3
DLGAP4-201ENST00000339266 MUC2Q02817 5179 aa6.95□□□□□ -1.3
DLGAP4-201ENST00000339266 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.94□□□□□ -1.3
DLGAP4-201ENST00000339266 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.91□□□□□ -1.3
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.86□□□□□ -1.31
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.81□□□□□ -1.32
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1GP13640 62 aa6.79□□□□□ -1.32
DLGAP4-201ENST00000339266 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.77□□□□□ -1.32
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2EP22531 72 aa6.73□□□□□ -1.33
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2BP35325 72 aa6.73□□□□□ -1.33
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2AP35326 72 aa6.73□□□□□ -1.33
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.71□□□□□ -1.33
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE3BQ5TA77 95 aa6.64□□□□□ -1.35
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1LQ93083 61 aa6.54□□□□□ -1.36
DLGAP4-201ENST00000339266 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
DLGAP4-201ENST00000339266 MT1EP04732 61 aa6.52□□□□□ -1.37
DLGAP4-201ENST00000339266 SPRR2DP22532 72 aa6.48□□□□□ -1.37
DLGAP4-201ENST00000339266 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms