RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287667.11

NOMO1-201, Transcript of NODAL modulator 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO1, Length 4,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.69□□□□□ -1.02
NOMO1-201ENST00000287667 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NOMO1-201ENST00000287667 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.69□□□□□ -1.02
NOMO1-201ENST00000287667 MT1HL1P0DM35 61 aa8.68□□□□□ -1.02
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.65□□□□□ -1.02
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.64□□□□□ -1.03
NOMO1-201ENST00000287667 DNHD1Q96M86 4753 aa8.64□□□□□ -1.03
NOMO1-201ENST00000287667 KMT2AQ03164 3969 aa8.62□□□□□ -1.03
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.59□□□□□ -1.04
NOMO1-201ENST00000287667 FAT1Q14517 4588 aa8.49□□□□□ -1.05
NOMO1-201ENST00000287667 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.48□□□□□ -1.05
NOMO1-201ENST00000287667 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.43□□□□□ -1.06
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.42□□□□□ -1.06
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.4□□□□□ -1.06
NOMO1-201ENST00000287667 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.4□□□□□ -1.06
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH2Q9P225 4427 aa8.37□□□□□ -1.07
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.37□□□□□ -1.07
NOMO1-201ENST00000287667 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.35□□□□□ -1.07
NOMO1-201ENST00000287667 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.32□□□□□ -1.08
NOMO1-201ENST00000287667 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.31□□□□□ -1.08
NOMO1-201ENST00000287667 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NOMO1-201ENST00000287667 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NOMO1-201ENST00000287667 MYCBP2O75592 4640 aa8.22□□□□□ -1.09
NOMO1-201ENST00000287667 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
NOMO1-201ENST00000287667 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.21□□□□□ -1.09
NOMO1-201ENST00000287667 RYR1P21817 5038 aa8.11□□□□□ -1.11
NOMO1-201ENST00000287667 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.09□□□□□ -1.11
NOMO1-201ENST00000287667 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.08□□□□□ -1.12
NOMO1-201ENST00000287667 PKHD1P08F94 4074 aa8.05□□□□□ -1.12
NOMO1-201ENST00000287667 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.02□□□□□ -1.13
NOMO1-201ENST00000287667 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.98□□□□□ -1.13
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.93□□□□□ -1.14
NOMO1-201ENST00000287667 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
NOMO1-201ENST00000287667 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.9□□□□□ -1.14
NOMO1-201ENST00000287667 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.9□□□□□ -1.15
NOMO1-201ENST00000287667 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
NOMO1-201ENST00000287667 PKD1P98161 4303 aa7.84□□□□□ -1.15
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP10-12P60413 245 aa7.8□□□□□ -1.16
NOMO1-201ENST00000287667 LCE3AQ5TA76 89 aa7.78□□□□□ -1.16
NOMO1-201ENST00000287667 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
NOMO1-201ENST00000287667 RYR3Q15413 4870 aa7.74□□□□□ -1.17
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP12-3P60328 96 aa7.71□□□□□ -1.18
NOMO1-201ENST00000287667 INE1O15225 51 aa7.68□□□□□ -1.18
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.65□□□□□ -1.19
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.64□□□□□ -1.19
NOMO1-201ENST00000287667 RYR2Q92736 4967 aa7.6□□□□□ -1.19
NOMO1-201ENST00000287667 LRP2P98164 4655 aa7.58□□□□□ -1.2
NOMO1-201ENST00000287667 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.5□□□□□ -1.21
NOMO1-201ENST00000287667 MT1HP80294 61 aa7.39□□□□□ -1.23
NOMO1-201ENST00000287667 HSPG2P98160 4391 aa7.39□□□□□ -1.23
NOMO1-201ENST00000287667 MT2AP02795 61 aa7.38□□□□□ -1.23
NOMO1-201ENST00000287667 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.38□□□□□ -1.23
NOMO1-201ENST00000287667 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.37□□□□□ -1.23
NOMO1-201ENST00000287667 MT1FP04733 61 aa7.31□□□□□ -1.24
NOMO1-201ENST00000287667 HERC2O95714 4834 aa7.3□□□□□ -1.24
NOMO1-201ENST00000287667 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOMO1-201ENST00000287667 LPAP08519 4548 aa7.27□□□□□ -1.25
NOMO1-201ENST00000287667 TNXBP22105 4242 aa7.22□□□□□ -1.25
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.16□□□□□ -1.26
NOMO1-201ENST00000287667 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.11□□□□□ -1.27
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.09□□□□□ -1.27
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP10-5P60370 271 aa7.05□□□□□ -1.28
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.99□□□□□ -1.29
NOMO1-201ENST00000287667 MUC2Q02817 5179 aa6.94□□□□□ -1.3
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NOMO1-201ENST00000287667 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.88□□□□□ -1.31
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.88□□□□□ -1.31
NOMO1-201ENST00000287667 LCE2CQ5TA81 110 aa6.85□□□□□ -1.31
NOMO1-201ENST00000287667 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.84□□□□□ -1.31
NOMO1-201ENST00000287667 MT1XP80297 61 aa6.83□□□□□ -1.32
NOMO1-201ENST00000287667 MT1BP07438 61 aa6.8□□□□□ -1.32
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.8□□□□□ -1.32
NOMO1-201ENST00000287667 HERC1Q15751 4861 aa6.78□□□□□ -1.32
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.76□□□□□ -1.33
NOMO1-201ENST00000287667 MUC17Q685J3 4493 aa6.76□□□□□ -1.33
NOMO1-201ENST00000287667 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.73□□□□□ -1.33
NOMO1-201ENST00000287667 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.71□□□□□ -1.34
NOMO1-201ENST00000287667 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.63□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.63□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.63□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 RNF213Q63HN8 5207 aa6.62□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.61□□□□□ -1.35
NOMO1-201ENST00000287667 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.56□□□□□ -1.36
NOMO1-201ENST00000287667 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.52□□□□□ -1.37
NOMO1-201ENST00000287667 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.5□□□□□ -1.37
NOMO1-201ENST00000287667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.48□□□□□ -1.37
NOMO1-201ENST00000287667 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.37□□□□□ -1.39
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.35□□□□□ -1.39
NOMO1-201ENST00000287667 LCE2BO14633 110 aa6.34□□□□□ -1.39
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP12-4P60329 112 aa6.31□□□□□ -1.4
NOMO1-201ENST00000287667 MT1GP13640 62 aa6.31□□□□□ -1.4
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.31□□□□□ -1.4
NOMO1-201ENST00000287667 LCE3BQ5TA77 95 aa6.24□□□□□ -1.41
NOMO1-201ENST00000287667 MT1LQ93083 61 aa6.1□□□□□ -1.43
NOMO1-201ENST00000287667 MT1EP04732 61 aa6.04□□□□□ -1.44
NOMO1-201ENST00000287667 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.94□□□□□ -1.46
NOMO1-201ENST00000287667 SPRR2EP22531 72 aa5.91□□□□□ -1.46
NOMO1-201ENST00000287667 SPRR2BP35325 72 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.8 ms