RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRB-201ENST00000261266 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRB-201ENST00000261266 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRB-201ENST00000261266 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRB-201ENST00000261266 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRB-201ENST00000261266 BSNQ9UPA5 3926 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-201ENST00000261266 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRB-201ENST00000261266 VPS13CQ709C8 3753 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRB-201ENST00000261266 LCE4AQ5TA78 99 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRB-201ENST00000261266 LYSTQ99698 3801 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.77□□□□□ -1.97
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