RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 LCE3AQ5TA76 89 aa7.12□□□□□ -1.27
LAMC1-201ENST00000258341 MT1HL1P0DM35 61 aa7.12□□□□□ -1.27
LAMC1-201ENST00000258341 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.12□□□□□ -1.27
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.1□□□□□ -1.27
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.1□□□□□ -1.27
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.04□□□□□ -1.28
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH2Q9P225 4427 aa6.98□□□□□ -1.29
LAMC1-201ENST00000258341 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.97□□□□□ -1.29
LAMC1-201ENST00000258341 KMT2AQ03164 3969 aa6.96□□□□□ -1.3
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.93□□□□□ -1.3
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.93□□□□□ -1.3
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.93□□□□□ -1.3
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.91□□□□□ -1.3
LAMC1-201ENST00000258341 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.88□□□□□ -1.31
LAMC1-201ENST00000258341 ANK2Q01484 3957 aa6.87□□□□□ -1.31
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LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LAMC1-201ENST00000258341 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.61□□□□□ -1.35
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LAMC1-201ENST00000258341 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.51□□□□□ -1.37
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LAMC1-201ENST00000258341 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.45□□□□□ -1.38
LAMC1-201ENST00000258341 MT1HP80294 61 aa6.41□□□□□ -1.38
LAMC1-201ENST00000258341 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LAMC1-201ENST00000258341 SPRR2EP22531 72 aa6.38□□□□□ -1.39
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LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.34□□□□□ -1.39
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.3□□□□□ -1.4
LAMC1-201ENST00000258341 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.28□□□□□ -1.4
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.27□□□□□ -1.41
LAMC1-201ENST00000258341 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.26□□□□□ -1.41
LAMC1-201ENST00000258341 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LAMC1-201ENST00000258341 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.22□□□□□ -1.41
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LAMC1-201ENST00000258341 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LAMC1-201ENST00000258341 SPRR2DP22532 72 aa6.15□□□□□ -1.43
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.14□□□□□ -1.43
LAMC1-201ENST00000258341 LCE3BQ5TA77 95 aa6.12□□□□□ -1.43
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.1□□□□□ -1.43
LAMC1-201ENST00000258341 MT1FP04733 61 aa6.09□□□□□ -1.43
LAMC1-201ENST00000258341 LCE2BO14633 110 aa6.03□□□□□ -1.44
LAMC1-201ENST00000258341 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.99□□□□□ -1.45
LAMC1-201ENST00000258341 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP12-4P60329 112 aa5.93□□□□□ -1.46
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMC1-201ENST00000258341 MT1GP13640 62 aa5.84□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 PKHD1P08F94 4074 aa5.83□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.81□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.8□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 PKD1P98161 4303 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMC1-201ENST00000258341 LCE2CQ5TA81 110 aa5.77□□□□□ -1.49
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LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.57□□□□□ -1.52
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LAMC1-201ENST00000258341 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.54□□□□□ -1.52
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.53□□□□□ -1.52
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.53□□□□□ -1.52
LAMC1-201ENST00000258341 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.47□□□□□ -1.53
LAMC1-201ENST00000258341 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.47□□□□□ -1.53
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LAMC1-201ENST00000258341 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
LAMC1-201ENST00000258341 HSPG2P98160 4391 aa5.4□□□□□ -1.54
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LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.39□□□□□ -1.55
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.39□□□□□ -1.55
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LAMC1-201ENST00000258341 LCE1DQ5T752 114 aa5.32□□□□□ -1.56
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.3□□□□□ -1.56
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LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.23□□□□□ -1.57
LAMC1-201ENST00000258341 MT1LQ93083 61 aa5.21□□□□□ -1.57
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LAMC1-201ENST00000258341 MT3P25713 68 aa5.13□□□□□ -1.59
LAMC1-201ENST00000258341 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
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LAMC1-201ENST00000258341 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.03□□□□□ -1.6
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LAMC1-201ENST00000258341 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.98□□□□□ -1.61
LAMC1-201ENST00000258341 MT1MQ8N339 61 aa4.97□□□□□ -1.61
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.96□□□□□ -1.61
LAMC1-201ENST00000258341 LCE1CQ5T751 118 aa4.91□□□□□ -1.62
LAMC1-201ENST00000258341 LCE1EQ5T753 118 aa4.91□□□□□ -1.62
LAMC1-201ENST00000258341 LCE1FQ5T754 118 aa4.91□□□□□ -1.62
LAMC1-201ENST00000258341 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.91□□□□□ -1.62
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.89□□□□□ -1.63
LAMC1-201ENST00000258341 LRP2P98164 4655 aa4.88□□□□□ -1.63
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