RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 CDK2AP2O75956 126 aa8.05□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.05□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1B0GVX0 72 aa8.03□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.02□□□□□ -1.12
FCHO1-221ENST00000597512 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
FCHO1-221ENST00000597512 hDV103S1A0JD37 113 aa8.02□□□□□ -1.13
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FCHO1-221ENST00000597512 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.98□□□□□ -1.13
FCHO1-221ENST00000597512 V9GYY9 64 aa7.98□□□□□ -1.13
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FCHO1-221ENST00000597512 PRR4Q16378 134 aa7.94□□□□□ -1.14
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FCHO1-221ENST00000597512 H3BPC8 53 aa7.89□□□□□ -1.15
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FCHO1-221ENST00000597512 Q5VSD8 79 aa7.77□□□□□ -1.17
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FCHO1-221ENST00000597512 A8MUN3 132 aa7.75□□□□□ -1.17
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FCHO1-221ENST00000597512 HSPG2P98160 4391 aa7.74□□□□□ -1.17
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FCHO1-221ENST00000597512 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.72□□□□□ -1.17
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FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.63□□□□□ -1.19
FCHO1-221ENST00000597512 PRR15LQ9BU68 103 aa7.61□□□□□ -1.19
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FCHO1-221ENST00000597512 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.56□□□□□ -1.2
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FCHO1-221ENST00000597512 A8MUU9 505 aa7.53□□□□□ -1.2
FCHO1-221ENST00000597512 LCA10Q71F78 164 aa7.53□□□□□ -1.2
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.52□□□□□ -1.21
FCHO1-221ENST00000597512 HRES1P13985 223 aa7.52□□□□□ -1.21
FCHO1-221ENST00000597512 A6NED7 52 aa7.51□□□□□ -1.21
FCHO1-221ENST00000597512 MT1HL1P0DM35 61 aa7.48□□□□□ -1.21
FCHO1-221ENST00000597512 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.47□□□□□ -1.21
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FCHO1-221ENST00000597512 MYCBP2O75592 4640 aa7.42□□□□□ -1.22
FCHO1-221ENST00000597512 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.42□□□□□ -1.22
FCHO1-221ENST00000597512 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.41□□□□□ -1.22
FCHO1-221ENST00000597512 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.41□□□□□ -1.22
FCHO1-221ENST00000597512 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
FCHO1-221ENST00000597512 SPINK7P58062 85 aa7.39□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 A6NN06 94 aa7.38□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.38□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.37□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.37□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 H3BS24 57 aa7.34□□□□□ -1.23
FCHO1-221ENST00000597512 XP32Q5T750 250 aa7.34□□□□□ -1.24
FCHO1-221ENST00000597512 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
FCHO1-221ENST00000597512 TPRXLQ17RH7 258 aa7.24□□□□□ -1.25
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