RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.28□□□□□ -1.72
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A20O43772 301 aa4.27□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 TRACP01848 142 aa4.27□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP10-5P60370 271 aa4.27□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 ATXN8Q156A1 80 aa4.27□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.27□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 H3BQ85 93 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 K7EP34 96 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 LST1O00453 97 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 MOBPQ13875 183 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00575Q6W349 94 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.26□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.25□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.25□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.25□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 hADV29S1A0JD25 119 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 C8orf87E5RJ46 101 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 K7ERU9 68 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 TCL1BO95988 128 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 DNAL4O96015 105 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.24□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 SPRR1BP22528 89 aa4.23□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.23□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC2BQ92478 149 aa4.23□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 J3QR89 54 aa4.22□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.22□□□□□ -1.73
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 F8W1H4 67 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 H3BMG7 143 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 H3BT86 120 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 TPRXLQ17RH7 258 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 Q6ZQY7 126 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.21□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.2□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.2□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.2□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.2□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0G2JQZ4 141 aa4.19□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 C9JAW5 83 aa4.19□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.19□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.18□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 C4orf26Q17RF5 130 aa4.18□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.18□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 SPINK1P00995 79 aa4.17□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 VPS25Q9BRG1 176 aa4.17□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 PRO0461Q9UI25 63 aa4.17□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.16□□□□□ -1.74
ATG4D-210ENST00000588972 F8WEM9 126 aa4.15□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.15□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 PDE6GP18545 87 aa4.14□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 MP68P56378 58 aa4.14□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 TEN1Q86WV5 123 aa4.14□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 IGFL1Q6UW32 110 aa4.13□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.13□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 A8MUU9 505 aa4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 LCE1EQ5T753 118 aa4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 Q6JHZ5 121 aa4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 LIMD2Q9BT23 127 aa4.12□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GV72 72 aa4.11□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 ETDBQ3ZM63 59 aa4.11□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.11□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.1□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GW54 56 aa4.1□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 SCGB1A1P11684 91 aa4.1□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.1□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 DSCR8Q96T75 97 aa4.1□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.09□□□□□ -1.75
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.08□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf195Q5TG92 126 aa4.08□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 Q5XG85 94 aa4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 Q6Q795 121 aa4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 SIGMAR1Q99720 223 aa4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.07□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf92A6NGG3 77 aa4.06□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 K7ERS5 55 aa4.06□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 CCKP06307 115 aa4.06□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 ACYP1P07311 99 aa4.06□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 Q6ZQT0 140 aa4.06□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PNM2 257 aa4.04□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087WSZ3 146 aa4.03□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP12-2P59991 146 aa4.03□□□□□ -1.76
ATG4D-210ENST00000588972 A8MWP4 228 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.02□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.01□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 MT1HP80294 61 aa4□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 Q96NJ1 140 aa4□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 UBL5Q9BZL1 73 aa3.99□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
ATG4D-210ENST00000588972 NREPQ16612 68 aa3.97□□□□□ -1.77
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