RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588657.5

ILF3-210, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 2,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-210ENST00000588657 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ILF3-210ENST00000588657 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.45□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.44□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.43□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 DNHD1Q96M86 4753 aa9.43□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.42□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ILF3-210ENST00000588657 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.39□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 IGLV7-43P04211 117 aa9.38□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 COA5Q86WW8 74 aa9.37□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.37□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.36□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.34□□□□□ -0.91
ILF3-210ENST00000588657 PCOTHQ58A44 107 aa9.33□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 TENM2Q9NT68 2774 aa9.32□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 H3BS24 57 aa9.32□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.32□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.31□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.31□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 A0A087X002 238 aa9.29□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.29□□□□□ -0.92
ILF3-210ENST00000588657 LINC00313P59037 77 aa9.26□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.26□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.26□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.24□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 SPINK7P58062 85 aa9.24□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.24□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 LINC01554Q52M75 96 aa9.23□□□□□ -0.93
ILF3-210ENST00000588657 LY6G6CO95867 125 aa9.21□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.21□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 HRES1P13985 223 aa9.2□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 Q5W150 140 aa9.19□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 DNAH2Q9P225 4427 aa9.19□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.17□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 Q6ZSA8 131 aa9.17□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 PRAC1Q96KF2 57 aa9.17□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.16□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP10-2P60368 255 aa9.15□□□□□ -0.94
ILF3-210ENST00000588657 FAM229AH3BQW9 127 aa9.15□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 FBN3Q75N90 2809 aa9.13□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 KMT2AQ03164 3969 aa9.13□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.12□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 ACYP2P14621 99 aa9.11□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.11□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.1□□□□□ -0.95
ILF3-210ENST00000588657 DMAC1Q96GE9 116 aa9.08□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.07□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP10-1P60331 282 aa9.07□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 IGKV2-30P06310 120 aa9.05□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.05□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.04□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.04□□□□□ -0.96
ILF3-210ENST00000588657 DNAH11Q96DT5 4516 aa9□□□□□ -0.97
ILF3-210ENST00000588657 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.99□□□□□ -0.97
ILF3-210ENST00000588657 TGP01266 2768 aa8.98□□□□□ -0.97
ILF3-210ENST00000588657 SPINK1P00995 79 aa8.96□□□□□ -0.97
ILF3-210ENST00000588657 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.94□□□□□ -0.98
ILF3-210ENST00000588657 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.92□□□□□ -0.98
ILF3-210ENST00000588657 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ILF3-210ENST00000588657 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.91□□□□□ -0.98
ILF3-210ENST00000588657 PKD1P98161 4303 aa8.88□□□□□ -0.99
ILF3-210ENST00000588657 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.84□□□□□ -0.99
ILF3-210ENST00000588657 CSAG1Q6PB30 78 aa8.84□□□□□ -0.99
ILF3-210ENST00000588657 A0A1B0GU69 56 aa8.84□□□□□ -0.99
ILF3-210ENST00000588657 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.84□□□□□ -0.99
ILF3-210ENST00000588657 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.81□□□□□ -1
ILF3-210ENST00000588657 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.81□□□□□ -1
ILF3-210ENST00000588657 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.79□□□□□ -1
ILF3-210ENST00000588657 UQCR11O14957 56 aa8.77□□□□□ -1.01
ILF3-210ENST00000588657 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.72□□□□□ -1.01
ILF3-210ENST00000588657 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.69□□□□□ -1.02
ILF3-210ENST00000588657 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.69□□□□□ -1.02
ILF3-210ENST00000588657 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.67□□□□□ -1.02
ILF3-210ENST00000588657 A8MUU9 505 aa8.67□□□□□ -1.02
ILF3-210ENST00000588657 ROMO1P60602 79 aa8.63□□□□□ -1.03
ILF3-210ENST00000588657 A0A1B0GVY2 172 aa8.6□□□□□ -1.03
ILF3-210ENST00000588657 Q8N1X5 172 aa8.6□□□□□ -1.03
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ILF3-210ENST00000588657 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.57□□□□□ -1.04
ILF3-210ENST00000588657 C9orf92A6NGG3 77 aa8.54□□□□□ -1.04
ILF3-210ENST00000588657 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.5□□□□□ -1.05
ILF3-210ENST00000588657 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.47□□□□□ -1.05
ILF3-210ENST00000588657 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ILF3-210ENST00000588657 PKHD1P08F94 4074 aa8.45□□□□□ -1.06
ILF3-210ENST00000588657 RYR2Q92736 4967 aa8.41□□□□□ -1.06
ILF3-210ENST00000588657 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ILF3-210ENST00000588657 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.4□□□□□ -1.07
ILF3-210ENST00000588657 P0C880 135 aa8.37□□□□□ -1.07
ILF3-210ENST00000588657 A0A1B0GU33 70 aa8.36□□□□□ -1.07
ILF3-210ENST00000588657 H0YAA0 97 aa8.35□□□□□ -1.07
ILF3-210ENST00000588657 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.34□□□□□ -1.07
ILF3-210ENST00000588657 KRTAP10-8P60410 259 aa8.31□□□□□ -1.08
ILF3-210ENST00000588657 FAT1Q14517 4588 aa8.28□□□□□ -1.08
ILF3-210ENST00000588657 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ILF3-210ENST00000588657 RYR3Q15413 4870 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms