RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 Q75L30 129 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS25Q9BRG1 176 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BQ85 93 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TRACP01848 142 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV4-1P06312 121 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CCKP06307 115 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2V1Q13404 147 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 A8MUU9 505 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00313P59037 77 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 DSCR8Q96T75 97 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 M0R143 59 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM6P0DI80 62 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 C9JAW5 83 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 ATXN8Q156A1 80 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 BATFQ16520 125 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM236CP0DP71 79 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GVX0 72 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TSTD3H0UI37 97 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C8orf87E5RJ46 101 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 J3KT08 172 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZQT0 140 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFB1O75438 58 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.41□□□□□ -1.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.39□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 MTURNQ8N3F0 131 aa5.39□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 A8MWP4 228 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 HRES1P13985 223 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 PDE6GP18545 87 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 NREPQ16612 68 aa5.36□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1B0GW54 56 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PPM0 123 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SPINK7P58062 85 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZVQ6 151 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BT86 120 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TAX1BP3O14907 124 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFS5O43920 106 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.31□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR15Q8IV56 129 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 K7EQZ3 153 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.28□□□□□ -1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 hDV103S1A0JD37 113 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 BPY2O14599 106 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MT2AP02795 61 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP10-10P60014 251 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8N9L7 120 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1FP04733 61 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2-30P06310 120 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-209ENST00000587957 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.21□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CASC2Q6XLA1 102 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HCG22E2RYF7 251 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 K7EP34 96 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 UBL5Q9BZL1 73 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.16□□□□□ -1.58
EFTUD2-209ENST00000587957 Q5W150 140 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00846Q9NV44 126 aa5.15□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PRO0461Q9UI25 63 aa5.14□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 USH2AO75445 5202 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL6P80162 114 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 C4orf26Q17RF5 130 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-209ENST00000587957 ETDBQ3ZM63 59 aa5.06□□□□□ -1.6
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SSPOA2VEC9 5147 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-209ENST00000587957 F8W1H4 67 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-209ENST00000587957 C5orf47Q569G3 176 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.5 ms