RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 PRR4Q16378 134 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZR54 194 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1B0GVX0 72 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 PMAIP1Q13794 54 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 Q75L30 129 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 A8MUN3 132 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 CHTF8P0CG12 524 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 Q5VV11 94 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 CD164Q04900 197 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 A6NED7 52 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFS5O43920 106 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 Q96NJ1 140 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRM-212ENST00000580838 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
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PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRM-212ENST00000580838 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRM-212ENST00000580838 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRM-212ENST00000580838 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-212ENST00000580838 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-212ENST00000580838 SPINK1P00995 79 aa3.29□□□□□ -1.88
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