RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572433.5

ITGAE-208, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 731 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-208ENST00000572433 CCKP06307 115 aa3.24□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 BAGE3Q86Y29 109 aa3.24□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 GNG13Q9P2W3 67 aa3.24□□□□□ -1.89
ITGAE-208ENST00000572433 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.23□□□□□ -1.89
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ITGAE-208ENST00000572433 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.23□□□□□ -1.89
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ITGAE-208ENST00000572433 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.23□□□□□ -1.89
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ITGAE-208ENST00000572433 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.2□□□□□ -1.9
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ITGAE-208ENST00000572433 OSTCQ9NRP0 149 aa3.13□□□□□ -1.91
ITGAE-208ENST00000572433 TNXBP22105 4242 aa3.12□□□□□ -1.91
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ITGAE-208ENST00000572433 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.08□□□□□ -1.92
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ITGAE-208ENST00000572433 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 ATXN8Q156A1 80 aa3.07□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.07□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 TMEM141Q96I45 108 aa3.07□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 hDV103S1A0JD37 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 K7EMI3 77 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 CLEC2BQ92478 149 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGAE-208ENST00000572433 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.06□□□□□ -1.92
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