RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 IMUPQ9GZP8 106 aa7.9□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf195Q5TG92 126 aa7.88□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.88□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PNM2 257 aa7.87□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 IGFL1Q6UW32 110 aa7.85□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZVQ6 151 aa7.85□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 PCOTHQ58A44 107 aa7.84□□□□□ -1.15
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.83□□□□□ -1.16
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.81□□□□□ -1.16
CMTM3-215ENST00000568477 NREPQ16612 68 aa7.81□□□□□ -1.16
CMTM3-215ENST00000568477 CXCL6P80162 114 aa7.8□□□□□ -1.16
CMTM3-215ENST00000568477 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 PCP4P48539 62 aa7.75□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 A0A087WSZ3 146 aa7.73□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 BPY2O14599 106 aa7.73□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 LCE2CQ5TA81 110 aa7.73□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.71□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.7□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.7□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.69□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 A0A087WVE0 104 aa7.67□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.66□□□□□ -1.18
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CMTM3-215ENST00000568477 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.65□□□□□ -1.18
CMTM3-215ENST00000568477 J3KT08 172 aa7.64□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 ATOX1O00244 68 aa7.64□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV4-1P06312 121 aa7.64□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 DSCR10P59022 87 aa7.64□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 Q75L30 129 aa7.62□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.61□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.61□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N9L7 120 aa7.61□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 Q96NJ1 140 aa7.59□□□□□ -1.19
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.58□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.58□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 A8MWP4 228 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 K7EQZ3 153 aa7.57□□□□□ -1.2
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CMTM3-215ENST00000568477 PRR15Q8IV56 129 aa7.56□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 M0R2T5 61 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFB1O75438 58 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 SERP2Q8N6R1 65 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-215ENST00000568477 A8MUU9 505 aa7.52□□□□□ -1.21
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CMTM3-215ENST00000568477 COX7CP15954 63 aa7.52□□□□□ -1.21
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.51□□□□□ -1.21
CMTM3-215ENST00000568477 UQCRQO14949 82 aa7.51□□□□□ -1.21
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CMTM3-215ENST00000568477 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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CMTM3-215ENST00000568477 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.42□□□□□ -1.22
CMTM3-215ENST00000568477 hDV103S1A0JD37 113 aa7.41□□□□□ -1.22
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.41□□□□□ -1.22
CMTM3-215ENST00000568477 C8orf87E5RJ46 101 aa7.41□□□□□ -1.22
CMTM3-215ENST00000568477 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.4□□□□□ -1.22
CMTM3-215ENST00000568477 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.39□□□□□ -1.23
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CMTM3-215ENST00000568477 C5orf47Q569G3 176 aa7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf197Q8N268 126 aa7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-215ENST00000568477 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-215ENST00000568477 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-215ENST00000568477 KLKP1Q107X0 134 aa7.34□□□□□ -1.23
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CMTM3-215ENST00000568477 FAM236CP0DP71 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFC1O43677 76 aa7.29□□□□□ -1.24
CMTM3-215ENST00000568477 H3BPC8 53 aa7.28□□□□□ -1.24
CMTM3-215ENST00000568477 MP68P56378 58 aa7.28□□□□□ -1.24
CMTM3-215ENST00000568477 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.28□□□□□ -1.24
CMTM3-215ENST00000568477 HRES1P13985 223 aa7.27□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.27□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 SNURFQ9Y675 71 aa7.27□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFS5O43920 106 aa7.26□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 H0Y9P7 68 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 H7BZZ5 65 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM258P61165 79 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00208Q96KT6 92 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM3-215ENST00000568477 SPINK7P58062 85 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM3-215ENST00000568477 Q5W150 140 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CMTM3-215ENST00000568477 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM3-215ENST00000568477 MT2AP02795 61 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM3-215ENST00000568477 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.08□□□□□ -1.28
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