RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	APC2	O95996	2303 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CACNA1B	Q00975	2339 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTA1	P02549	2419 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A087WTM6	91 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A096LNT2	108 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC01549	A6NIU2	74 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		D6R8Y8	96 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		F8WEM9	126 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		H0YGG7	62 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UQCR11	O14957	56 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFC1	O43677	76 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PRH1	P02810	166 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MGP	P08493	103 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	IFI6	P09912	130 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CCL18	P55774	89 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM11A	P58511	58 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	WT1-AS	Q06250	92 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6JHZ5	121 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00575	Q6W349	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZRX8	168 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LEAP2	Q969E1	77 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TRGV9	Q99603	122 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		U3KQA8	63 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DNHD1	Q96M86	4753 aa		0.31	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPG11	Q96JI7	2443 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	HERC2	O95714	4834 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		H7BZZ5	65 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		I3L2K1	104 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		I3L3M4	83 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		K7EIM0	57 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	APELA	P0DMC3	54 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SERF2	P84101	59 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CNFN	Q9BYD5	112 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC00846	Q9NV44	126 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LPA	P08519	4548 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MTOR	P42345	2549 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.3	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF213	Q63HN8	5207 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	LCE6A	A0A183	80 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GU69	56 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GUT8	65 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BVH4	76 aa		0.29	□□□□□ -2.36
SNAP23-215	ENST00000568227		M0R1W7	72 aa		0.29	□□□□□ -2.36

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