RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00483Q53H64 154 aa6.09□□□□□ -1.43
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MU10 97 aa6.08□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 MOBPQ13875 183 aa6.08□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q1T7F1 81 aa6.08□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV7-43P04211 117 aa6.07□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 HCG22E2RYF7 251 aa6.07□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.07□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 MP68P56378 58 aa6.06□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.06□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR4Q16378 134 aa6.05□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZSA8 131 aa6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 A6NN06 94 aa6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01554Q52M75 96 aa6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.04□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q96NJ1 140 aa6.03□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.02□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 LCE6AA0A183 80 aa6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A087X002 238 aa5.99□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MWP4 228 aa5.99□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 RYR2Q92736 4967 aa5.99□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 CASC2Q6XLA1 102 aa5.98□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.97□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00208Q96KT6 92 aa5.97□□□□□ -1.45
CCNDBP1-210ENST00000566882 hDV103S1A0JD37 113 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAT1Q14517 4588 aa5.95□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0Y9P7 68 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q5VV11 94 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.92□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFB1O75438 58 aa5.9□□□□□ -1.46
CCNDBP1-210ENST00000566882 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.9□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GVX0 72 aa5.89□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GVY2 172 aa5.89□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRAC1Q96KF2 57 aa5.89□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 A6NED7 52 aa5.88□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.88□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 RYR3Q15413 4870 aa5.87□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.87□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCOTHQ58A44 107 aa5.86□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDK2AP2O75956 126 aa5.85□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.84□□□□□ -1.47
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR15LQ9BU68 103 aa5.83□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.83□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.83□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 LIMD2Q9BT23 127 aa5.81□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q75L30 129 aa5.8□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.8□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q5W150 140 aa5.79□□□□□ -1.48
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BPC8 53 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.76□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.75□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.74□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPG2P98160 4391 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 COA5Q86WW8 74 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.71□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.71□□□□□ -1.49
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPINK1P00995 79 aa5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.68□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 RYR1P21817 5038 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 HRES1P13985 223 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNXBP22105 4242 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf92A6NGG3 77 aa5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 J3QL48 77 aa5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYCBP2O75592 4640 aa5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q5VSD8 79 aa5.61□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 ROMO1P60602 79 aa5.61□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSAG1Q6PB30 78 aa5.61□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM229AH3BQW9 127 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8N1X5 172 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV2-30P06310 120 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPINK7P58062 85 aa5.57□□□□□ -1.52
CCNDBP1-210ENST00000566882 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
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