RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 NCOR1O75376 2440 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 FRYLO94915 3013 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 COL6A5A8TX70 2615 aa0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 FAM186AA6NE01 2351 aa0.61□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 M0R2T5 61 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 SMR3AQ99954 134 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 UTRNP46939 3433 aa0.61□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 NBASA2RRP1 2371 aa0.61□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.6□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 TRANK1O15050 2925 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa0.6□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 CREBBPQ92793 2442 aa0.6□□□□□ -2.31
TMOD3-205ENST00000558714 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.6□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 SZT2Q5T011 3432 aa0.6□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.59□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 CEP290O15078 2479 aa0.59□□□□□ -2.31
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TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.58□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.58□□□□□ -2.32
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TMOD3-205ENST00000558714 NOTCH1P46531 2555 aa0.58□□□□□ -2.32
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TMOD3-205ENST00000558714 SPG11Q96JI7 2443 aa0.57□□□□□ -2.32
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TMOD3-205ENST00000558714 C5orf42Q9H799 3197 aa0.56□□□□□ -2.32
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TMOD3-205ENST00000558714 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 TGP01266 2768 aa0.54□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 LAMA1P25391 3075 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 CENPEQ02224 2701 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 ATMQ13315 3056 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 LAMA3Q16787 3333 aa0.53□□□□□ -2.32
TMOD3-205ENST00000558714 ITPR3Q14573 2671 aa0.53□□□□□ -2.32
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