RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552013.1

NAP1L1-223, Transcript of nucleosome assembly protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene NAP1L1, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAP1L1-223	ENST00000552013	DPM2	O94777	84 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	LINC00575	Q6W349	94 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	SIGMAR1	Q99720	223 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013		A0A087WSZ3	146 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	IGKC	P01834	107 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
NAP1L1-223	ENST00000552013		A6NDN8	102 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	TEN1	Q86WV5	123 aa		2.96	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	hADV29S1	A0JD25	119 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		2.95	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		2.94	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	TMEM218	A2RU14	115 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	LEPROTL1	O95214	131 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	IGKV4-1	P06312	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		2.93	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	HSBP1	O75506	76 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		2.92	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	IMUP	Q9GZP8	106 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		2.91	□□□□□ -1.94
NAP1L1-223	ENST00000552013	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		2.9	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		2.9	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	IFITM1	P13164	125 aa		2.9	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	VAMP3	Q15836	100 aa		2.9	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		2.89	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	C3orf79	P0CE67	100 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	FABP4	P15090	132 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	UQCC3	Q6UW78	93 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	COPS9	Q8WXC6	57 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		2.88	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	C8orf87	E5RJ46	101 aa		2.87	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.86	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013		A0A1B0GVX0	72 aa		2.86	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	RAB37	Q96AX2	223 aa		2.86	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	CLLU1	Q5K131	121 aa		2.85	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	YPEL4	Q96NS1	127 aa		2.85	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	MT1X	P80297	61 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	C5orf47	Q569G3	176 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NAP1L1-223	ENST00000552013		H3BMG7	143 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	KLKP1	Q107X0	134 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		2.82	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	LINC01545	Q5VT33	79 aa		2.82	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.82	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		2.81	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		2.81	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	C12orf57	Q99622	126 aa		2.81	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	TRGC2	P03986	189 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	DSCR8	Q96T75	97 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NAP1L1-223	ENST00000552013	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	PET117	Q6UWS5	81 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	PRR15	Q8IV56	129 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	TRAC	P01848	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	FABP2	P12104	132 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	CSAG1	Q6PB30	78 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	OCR1	Q9BZK8	76 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	CRIPT	Q9P021	101 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	LCA10	Q71F78	164 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		S4R3F8	94 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		A0A1B0GV72	72 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		J3KT08	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	SNAPIN	O95295	136 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	APOC3	P02656	99 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	CCK	P06307	115 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	C4orf26	Q17RF5	130 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		H0YGX0	51 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		Q6ZVQ6	151 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013	SVBP	Q8N300	66 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NAP1L1-223	ENST00000552013		A0A1B0GX51	115 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	SNCG	O76070	127 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	NDUFB1	O75438	58 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	MT4	P47944	62 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	ATOH7	Q8N100	152 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013		Q5W150	140 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	KRTDAP	P60985	99 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		2.66	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	NDUFA5	Q16718	116 aa		2.66	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	VPS25	Q9BRG1	176 aa		2.66	□□□□□ -1.98
NAP1L1-223	ENST00000552013	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NAP1L1-223	ENST00000552013		Q6ZQT0	140 aa		2.65	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms