RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.69□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.68□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 ATMQ13315 3056 aa3.67□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 AKAP9Q99996 3911 aa3.67□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.67□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 S4R3F8 94 aa3.67□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 FBN2P35556 2912 aa3.65□□□□□ -1.82
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.64□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 COL6A3P12111 3177 aa3.63□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.62□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 LAMA3Q16787 3333 aa3.62□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 CDH23Q9H251 3354 aa3.61□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 PDZD2O15018 2839 aa3.61□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.6□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 P0C880 135 aa3.59□□□□□ -1.83
HECTD4-211ENST00000550722 R4GN34 69 aa3.58□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 PP632Q6XCG6 107 aa3.58□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 M0R2T5 61 aa3.58□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.57□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 M0QZ58 72 aa3.57□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 VWFP04275 2813 aa3.55□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 TGP01266 2768 aa3.54□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HECTD4-211ENST00000550722 H0YAA0 97 aa3.51□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 BRCA2P51587 3418 aa3.51□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 VCANP13611 3396 aa3.5□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP10-1P60331 282 aa3.5□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.49□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.48□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.47□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 TENM2Q9NT68 2774 aa3.47□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 Q5VSD8 79 aa3.47□□□□□ -1.85
HECTD4-211ENST00000550722 DMDP11532 3685 aa3.44□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP10-2P60368 255 aa3.43□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 EYSQ5T1H1 3165 aa3.43□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.43□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 SZT2Q5T011 3432 aa3.42□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 SPEGQ15772 3267 aa3.42□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 INE1O15225 51 aa3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.4□□□□□ -1.86
HECTD4-211ENST00000550722 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.38□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.37□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 TPRXLQ17RH7 258 aa3.37□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.37□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.37□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 TNP1P09430 55 aa3.35□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 COL7A1Q02388 2944 aa3.35□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.34□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.34□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.34□□□□□ -1.87
HECTD4-211ENST00000550722 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.32□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.31□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.29□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.29□□□□□ -1.88
HECTD4-211ENST00000550722 USP34Q70CQ2 3546 aa3.27□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 LAMA5O15230 3695 aa3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 ANK2Q01484 3957 aa3.24□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP10-8P60410 259 aa3.23□□□□□ -1.89
HECTD4-211ENST00000550722 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.2□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 FBN3Q75N90 2809 aa3.2□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 VPS13CQ709C8 3753 aa3.2□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 XP32Q5T750 250 aa3.2□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.19□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH2Q9P225 4427 aa3.18□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.18□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.17□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.17□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.17□□□□□ -1.9
HECTD4-211ENST00000550722 LYSTQ99698 3801 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.13□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.12□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.12□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP12-1P59990 96 aa3.12□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP12-2P59991 146 aa3.11□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.1□□□□□ -1.91
HECTD4-211ENST00000550722 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.08□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 BSNQ9UPA5 3926 aa3.07□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.06□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.05□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 A0A1B0GVY2 172 aa3.04□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP10-10P60014 251 aa3.04□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms