RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549572.5

TARBP2-211, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,514 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-211ENST00000549572 HSPG2P98160 4391 aa8.98□□□□□ -0.97
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TARBP2-211ENST00000549572 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.97□□□□□ -0.97
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TARBP2-211ENST00000549572 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.95□□□□□ -0.98
TARBP2-211ENST00000549572 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.95□□□□□ -0.98
TARBP2-211ENST00000549572 hDV103S1A0JD37 113 aa8.95□□□□□ -0.98
TARBP2-211ENST00000549572 C1orf195Q5TG92 126 aa8.95□□□□□ -0.98
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TARBP2-211ENST00000549572 FAM236CP0DP71 79 aa8.94□□□□□ -0.98
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TARBP2-211ENST00000549572 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.93□□□□□ -0.98
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TARBP2-211ENST00000549572 OXTP01178 125 aa8.83□□□□□ -1
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TARBP2-211ENST00000549572 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.72□□□□□ -1.01
TARBP2-211ENST00000549572 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.72□□□□□ -1.01
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TARBP2-211ENST00000549572 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.7□□□□□ -1.02
TARBP2-211ENST00000549572 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.7□□□□□ -1.02
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TARBP2-211ENST00000549572 Q5W150 140 aa8.64□□□□□ -1.03
TARBP2-211ENST00000549572 C4orf26Q17RF5 130 aa8.64□□□□□ -1.03
TARBP2-211ENST00000549572 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.61□□□□□ -1.03
TARBP2-211ENST00000549572 MT1HL1P0DM35 61 aa8.6□□□□□ -1.03
TARBP2-211ENST00000549572 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.6□□□□□ -1.03
TARBP2-211ENST00000549572 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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TARBP2-211ENST00000549572 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.52□□□□□ -1.04
TARBP2-211ENST00000549572 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.52□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 MYCBP2O75592 4640 aa8.51□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 IGKV2-30P06310 120 aa8.51□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 C9orf92A6NGG3 77 aa8.5□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 PCOTHQ58A44 107 aa8.49□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.47□□□□□ -1.05
TARBP2-211ENST00000549572 Q75L30 129 aa8.45□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.44□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 PRR4Q16378 134 aa8.44□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 PRO0628Q9UI54 55 aa8.44□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 Q1T7F1 81 aa8.41□□□□□ -1.06
TARBP2-211ENST00000549572 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.39□□□□□ -1.07
TARBP2-211ENST00000549572 HRES1P13985 223 aa8.38□□□□□ -1.07
TARBP2-211ENST00000549572 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.38□□□□□ -1.07
TARBP2-211ENST00000549572 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.37□□□□□ -1.07
TARBP2-211ENST00000549572 V9GYY9 64 aa8.37□□□□□ -1.07
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TARBP2-211ENST00000549572 DMAC1Q96GE9 116 aa8.32□□□□□ -1.08
TARBP2-211ENST00000549572 COA5Q86WW8 74 aa8.3□□□□□ -1.08
TARBP2-211ENST00000549572 TPRXLQ17RH7 258 aa8.29□□□□□ -1.08
TARBP2-211ENST00000549572 BRK1Q8WUW1 75 aa8.28□□□□□ -1.08
TARBP2-211ENST00000549572 ACYP2P14621 99 aa8.26□□□□□ -1.09
TARBP2-211ENST00000549572 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.26□□□□□ -1.09
TARBP2-211ENST00000549572 SPINK7P58062 85 aa8.24□□□□□ -1.09
TARBP2-211ENST00000549572 A8MUN3 132 aa8.2□□□□□ -1.1
TARBP2-211ENST00000549572 J3QL48 77 aa8.2□□□□□ -1.1
TARBP2-211ENST00000549572 PSPHP1O15172 72 aa8.15□□□□□ -1.1
TARBP2-211ENST00000549572 Q5VV11 94 aa8.13□□□□□ -1.11
TARBP2-211ENST00000549572 HERC1Q15751 4861 aa8.13□□□□□ -1.11
TARBP2-211ENST00000549572 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.09□□□□□ -1.11
TARBP2-211ENST00000549572 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.09□□□□□ -1.11
TARBP2-211ENST00000549572 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.08□□□□□ -1.12
TARBP2-211ENST00000549572 PRR15LQ9BU68 103 aa8.08□□□□□ -1.12
TARBP2-211ENST00000549572 LRP2P98164 4655 aa8.07□□□□□ -1.12
TARBP2-211ENST00000549572 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.07□□□□□ -1.12
TARBP2-211ENST00000549572 LPAP08519 4548 aa8.05□□□□□ -1.12
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