RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542705.1

CD163-211, Transcript of CD163 molecule, humanhuman

TSL 3

Gene CD163, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163-211ENST00000542705 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.48□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 PCNTO95613 3336 aa-1.49□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 S100A8P05109 93 aa-1.5□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 PRO3102Q9H379 93 aa-1.5□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1.5□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.51□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.51□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 PKIAP61925 76 aa-1.51□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.51□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.51□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.52□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 SZT2Q5T011 3432 aa-1.52□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 C3orf79P0CE67 100 aa-1.52□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.53□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
CD163-211ENST00000542705 C4AP0C0L4 1744 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 C4BP0C0L5 1744 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 M0QZ58 72 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 LEAP2Q969E1 77 aa-1.54□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.55□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 PLXNC1O60486 1568 aa-1.55□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.55□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.56□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.56□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.56□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.57□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 SMARCA2P51531 1590 aa-1.57□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 UNC80Q8N2C7 3258 aa-1.58□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 CENPFP49454 3210 aa-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.59□□□□□ -2.66
CD163-211ENST00000542705 NDUFB1O75438 58 aa-1.6□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.6□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 AKAP12Q02952 1782 aa-1.61□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.61□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.61□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 LINC00158P58513 81 aa-1.61□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 EEA1Q15075 1411 aa-1.62□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.62□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.63□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.63□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.63□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.63□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.64□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.65□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 M0QY20 66 aa-1.65□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 NWD1Q149M9 1564 aa-1.65□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 LTN1O94822 1766 aa-1.65□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.66□□□□□ -2.67
CD163-211ENST00000542705 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.66□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.66□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 WIZO95785 1651 aa-1.66□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.66□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.67□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 ACYP1P07311 99 aa-1.67□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.67□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 Q9H521 79 aa-1.67□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 NCOA2Q15596 1464 aa-1.68□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 LY75O60449 1722 aa-1.68□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 IAPPP10997 89 aa-1.68□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.68□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 NESP48681 1621 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 IFI6P09912 130 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 WT1-ASQ06250 92 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 KIF21BO75037 1637 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-1.69□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 CROCC2H7BZ55 1655 aa-1.7□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 H3BUA1 57 aa-1.7□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 V9GYS6 101 aa-1.7□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 ERVK-7P63135 1459 aa-1.7□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 BRCA2P51587 3418 aa-1.7□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.71□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 ASPMQ8IZT6 3477 aa-1.71□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.71□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.71□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 CDH23Q9H251 3354 aa-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 DEPDC5O75140 1603 aa-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.72□□□□□ -2.68
CD163-211ENST00000542705 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.72□□□□□ -2.69
CD163-211ENST00000542705 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.73□□□□□ -2.69
CD163-211ENST00000542705 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.74□□□□□ -2.69
CD163-211ENST00000542705 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.74□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms