RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFC1O43677 76 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZSA8 131 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 FAT1Q14517 4588 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-216ENST00000524481 V9GYY9 64 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 MP68P56378 58 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 PCOTHQ58A44 107 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 PSPHP1O15172 72 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 H0Y9P7 68 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 Q96NJ1 140 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1B0GVX0 72 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-216ENST00000524481 PKD1P98161 4303 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 SEC61GP60059 68 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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PTPRK-216ENST00000524481 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 C9orf92A6NGG3 77 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1B0GVY2 172 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 FAM229AH3BQW9 127 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 LIMD2Q9BT23 127 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 PMAIP1Q13794 54 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 RYR2Q92736 4967 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 A8MUN3 132 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 Q5W150 140 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRK-216ENST00000524481 CD164Q04900 197 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV2-30P06310 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 SPINK1P00995 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 Q5VSD8 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 RYR3Q15413 4870 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-216ENST00000524481 A8MU10 97 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRK-216ENST00000524481 C8orf87E5RJ46 101 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-216ENST00000524481 A6NED7 52 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-216ENST00000524481 Q1T7F1 81 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-216ENST00000524481 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-216ENST00000524481 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 RYR1P21817 5038 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 HSPG2P98160 4391 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 LCA10Q71F78 164 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 ACYP2P14621 99 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP10-8P60410 259 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-216ENST00000524481 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-216ENST00000524481 SPINK7P58062 85 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-216ENST00000524481 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-216ENST00000524481 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-216ENST00000524481 J3QL48 77 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 Q75L30 129 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 PRAC1Q96KF2 57 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 A8MUU9 505 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 MT1HL1P0DM35 61 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 DMAC1Q96GE9 116 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-216ENST00000524481 A6NN06 94 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 XP32Q5T750 250 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-216ENST00000524481 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.23□□□□□ -1.41
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