RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGA3-215ENST00000515147 A0A1W2PPM0 123 aa8.91□□□□□ -0.98
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ITGA3-215ENST00000515147 K7EP34 96 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGA3-215ENST00000515147 K7ERJ3 54 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGA3-215ENST00000515147 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.88□□□□□ -0.99
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ITGA3-215ENST00000515147 J3QR89 54 aa8.59□□□□□ -1.03
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ITGA3-215ENST00000515147 Q6ZQT0 140 aa8.57□□□□□ -1.04
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ITGA3-215ENST00000515147 H3BT86 120 aa8.54□□□□□ -1.04
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ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGA3-215ENST00000515147 SCGB1A1P11684 91 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 NREPQ16612 68 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 ACYP1P07311 99 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 PCP4P48539 62 aa8.31□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 hDV103S1A0JD37 113 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 NDUFS5O43920 106 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGA3-215ENST00000515147 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.29□□□□□ -1.08
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ITGA3-215ENST00000515147 Q5W150 140 aa8.26□□□□□ -1.09
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ITGA3-215ENST00000515147 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.25□□□□□ -1.09
ITGA3-215ENST00000515147 A6NN06 94 aa8.21□□□□□ -1.1
ITGA3-215ENST00000515147 MT1BP07438 61 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA3-215ENST00000515147 C4orf26Q17RF5 130 aa8.2□□□□□ -1.1
ITGA3-215ENST00000515147 LINC00643Q86TS7 51 aa8.18□□□□□ -1.1
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ITGA3-215ENST00000515147 C5orf47Q569G3 176 aa8.16□□□□□ -1.1
ITGA3-215ENST00000515147 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.15□□□□□ -1.1
ITGA3-215ENST00000515147 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.15□□□□□ -1.1
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ITGA3-215ENST00000515147 IMUPQ9GZP8 106 aa8.14□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 Q5VV11 94 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 HCG22E2RYF7 251 aa8.11□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 CASC2Q6XLA1 102 aa8.1□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 Q8N9L7 120 aa8.1□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.09□□□□□ -1.11
ITGA3-215ENST00000515147 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.09□□□□□ -1.11
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