RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BVH4 76 aa1.96□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 COX6A2Q02221 97 aa1.96□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 F2Z2F3 143 aa1.95□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CLPSL2Q6UWE3 100 aa1.95□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa1.95□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NEBP20929 6669 aa1.95□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MGPP08493 103 aa1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 GCHFRP30047 84 aa1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PLAC4Q8WY50 150 aa1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 V9GYH0 126 aa1.94□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.93□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R17O96001 155 aa1.93□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa1.93□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 S100ZQ8WXG8 99 aa1.93□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A096LNI7 61 aa1.92□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MPC2O95563 127 aa1.92□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01545Q5VT33 79 aa1.92□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 BAGE2Q86Y30 109 aa1.92□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA12Q9UI09 145 aa1.92□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 LPAP08519 4548 aa1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFA1O15239 70 aa1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FCER1GP30273 86 aa1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZUT4 128 aa1.91□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.1
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 UMAD1C9J7I0 102 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC179H3BU77 68 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 I3L3M4 83 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 M0QY20 66 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SPAG11AQ6PDA7 123 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 MANBALQ9NQG1 85 aa1.9□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa1.89□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SPAG11BQ08648 103 aa1.89□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNRGQ8N5I3 272 aa1.89□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 ST20Q9HBF5 79 aa1.89□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SIX6O95475 246 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 GNG4P50150 75 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 CRIP1P50238 77 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC11AP67812 179 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 IFI27L1Q96BM0 104 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM191AQ9H0A3 160 aa1.88□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf88Q9BSF0 95 aa1.87□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa1.87□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 USH2AO75445 5202 aa1.87□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 S100A8P05109 93 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf62Q8N4C0 152 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM213BQ8TBF2 198 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 CNFNQ9BYD5 112 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.86□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GUT8 65 aa1.85□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 BCE1O60756 84 aa1.85□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf38Q86SI9 138 aa1.85□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.85□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01549A6NIU2 74 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SPINK1P00995 79 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 KLKP1Q107X0 134 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 SFTA2Q6UW10 78 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 C20orf78Q9BR46 151 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 GNG13Q9P2W3 67 aa1.84□□□□□ -2.11
PGGT1B-205ENST00000514178 F8VRH5 84 aa1.83□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00846Q9NV44 126 aa1.83□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 TOMM7Q9P0U1 55 aa1.83□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 K7EMI3 77 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8IZM0 81 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM141Q96I45 108 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf48Q9UBA6 75 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 M0R2T5 61 aa1.81□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00587B1AMM8 73 aa1.8□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1.8□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.8□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 NPC2P61916 151 aa1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 COX17Q14061 63 aa1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 ALKAL2Q6UX46 152 aa1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa1.78□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.78□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.78□□□□□ -2.12
PGGT1B-205ENST00000514178 KMT2DO14686 5537 aa1.77□□□□□ -2.13
PGGT1B-205ENST00000514178 D6R8Y8 96 aa1.77□□□□□ -2.13
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL39P62891 51 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
PGGT1B-205ENST00000514178 COX7B2Q8TF08 81 aa1.77□□□□□ -2.13
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