RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508777.5

RAI14-213, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 1 (best)

Gene RAI14, Length 1,387 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-213	ENST00000508777	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAI14-213	ENST00000508777	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAI14-213	ENST00000508777	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAI14-213	ENST00000508777		A0A1W2PNM2	257 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI14-213	ENST00000508777	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAI14-213	ENST00000508777		A0A087WSZ3	146 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	NREP	Q16612	68 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	HERC2	O95714	4834 aa		5	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777		J3KT08	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAI14-213	ENST00000508777	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	NDUFB1	O75438	58 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777		Q6ZVQ6	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	BPY2	O14599	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	TNXB	P22105	4242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	CXCL6	P80162	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	PRR4	Q16378	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI14-213	ENST00000508777	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777		Q96NJ1	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777		A8MWP4	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	UQCRQ	O14949	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777		A0A1B0GVX0	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	LINC00313	P59037	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	DSCR10	P59022	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAI14-213	ENST00000508777	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	COX7C	P15954	63 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777		H3BS24	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777		K7EQZ3	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	ATOX1	O00244	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	TMEM258	P61165	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI14-213	ENST00000508777	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777		Q8N9L7	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777		Q75L30	129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777		A8MUU9	505 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	NDUFS5	O43920	106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAI14-213	ENST00000508777		A0A087WVE0	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAI14-213	ENST00000508777	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAI14-213	ENST00000508777	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAI14-213	ENST00000508777	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RAI14-213	ENST00000508777	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	MP68	P56378	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	HERC1	Q15751	4861 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	NDUFC1	O43677	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777		H3BPC8	53 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAI14-213	ENST00000508777	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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