RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.04□□□□□ -1.28
IRF1-210ENST00000493208 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.03□□□□□ -1.28
IRF1-210ENST00000493208 FAM236CP0DP71 79 aa7.03□□□□□ -1.28
IRF1-210ENST00000493208 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 MTURNQ8N3F0 131 aa7.02□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 A0A1B0GVX0 72 aa7.01□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.01□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 SMIM6P0DI80 62 aa6.99□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 TSTD3H0UI37 97 aa6.98□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 Q6ZQT0 140 aa6.97□□□□□ -1.29
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.96□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.96□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.95□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 A8MWP4 228 aa6.91□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 NREPQ16612 68 aa6.9□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.9□□□□□ -1.3
IRF1-210ENST00000493208 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 BATFQ16520 125 aa6.88□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.87□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.86□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 H3BT86 120 aa6.85□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.84□□□□□ -1.31
IRF1-210ENST00000493208 HRES1P13985 223 aa6.83□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 SPINK7P58062 85 aa6.83□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 Q6ZVQ6 151 aa6.83□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 PRR15Q8IV56 129 aa6.82□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 C9orf118A6NHY6 69 aa6.81□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.81□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.8□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.79□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 A0A1W2PPM0 123 aa6.78□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
IRF1-210ENST00000493208 BPY2O14599 106 aa6.77□□□□□ -1.33
IRF1-210ENST00000493208 NDUFS5O43920 106 aa6.77□□□□□ -1.33
IRF1-210ENST00000493208 hDV103S1A0JD37 113 aa6.76□□□□□ -1.33
IRF1-210ENST00000493208 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.75□□□□□ -1.33
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.74□□□□□ -1.33
IRF1-210ENST00000493208 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.71□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 TAX1BP3O14907 124 aa6.71□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.71□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 K7EQZ3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP10-10P60014 251 aa6.69□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 UBL5Q9BZL1 73 aa6.69□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 MT2AP02795 61 aa6.66□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.66□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 CASC2Q6XLA1 102 aa6.66□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.66□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 LINC00846Q9NV44 126 aa6.66□□□□□ -1.34
IRF1-210ENST00000493208 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.64□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 CXCL6P80162 114 aa6.63□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.63□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.62□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 IGKV2-30P06310 120 aa6.62□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 HCG22E2RYF7 251 aa6.6□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.6□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 MT1FP04733 61 aa6.59□□□□□ -1.35
IRF1-210ENST00000493208 K7EP34 96 aa6.56□□□□□ -1.36
IRF1-210ENST00000493208 Q8N9L7 120 aa6.55□□□□□ -1.36
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.54□□□□□ -1.36
IRF1-210ENST00000493208 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.53□□□□□ -1.36
IRF1-210ENST00000493208 F8W1H4 67 aa6.52□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 Q5W150 140 aa6.51□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 PRO0461Q9UI25 63 aa6.48□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 LCE2BO14633 110 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 USH2AO75445 5202 aa6.47□□□□□ -1.37
IRF1-210ENST00000493208 C4orf26Q17RF5 130 aa6.46□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.43□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 ACYP1P07311 99 aa6.42□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 ETDBQ3ZM63 59 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 S4R3F8 94 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 SSPOA2VEC9 5147 aa6.41□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 CSAG1Q6PB30 78 aa6.4□□□□□ -1.38
IRF1-210ENST00000493208 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.39□□□□□ -1.39
IRF1-210ENST00000493208 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.38□□□□□ -1.39
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IRF1-210ENST00000493208 C5orf47Q569G3 176 aa6.36□□□□□ -1.39
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.34□□□□□ -1.39
IRF1-210ENST00000493208 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.33□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.32□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 ATOX1O00244 68 aa6.31□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.28□□□□□ -1.4
IRF1-210ENST00000493208 UQCRQO14949 82 aa6.27□□□□□ -1.41
IRF1-210ENST00000493208 LCA10Q71F78 164 aa6.27□□□□□ -1.41
IRF1-210ENST00000493208 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.24□□□□□ -1.41
IRF1-210ENST00000493208 Q5VV11 94 aa6.21□□□□□ -1.42
IRF1-210ENST00000493208 CRIPTQ9P021 101 aa6.21□□□□□ -1.42
IRF1-210ENST00000493208 H0Y9P7 68 aa6.2□□□□□ -1.42
IRF1-210ENST00000493208 LINC00643Q86TS7 51 aa6.2□□□□□ -1.42
IRF1-210ENST00000493208 IMUPQ9GZP8 106 aa6.2□□□□□ -1.42
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