RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489838.5

WDR48-210, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 3

Gene WDR48, Length 360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-210ENST00000489838 SMIM11AP58511 58 aa-0.63□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.63□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 FANCAO15360 1455 aa-0.63□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.63□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.63□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 TJP1Q07157 1748 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 UBR1Q8IWV7 1749 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 ATMQ13315 3056 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 SMARCA2P51531 1590 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 ITPR2Q14571 2701 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.64□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 ATP10BO94823 1461 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 A8MTW9 85 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 MT-ATP8P03928 68 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 LINC00032P0C843 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 PEA15Q15121 130 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 DPY30Q9C005 99 aa-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.66□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.66□□□□□ -2.51
WDR48-210ENST00000489838 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 M0QY20 66 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NDUFA4O00483 81 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MT1FP04733 61 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RICTORQ6R327 1708 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NCOA2Q15596 1464 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 AKAP12Q02952 1782 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.67□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CRIP1P50238 77 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ERVK-7P63135 1459 aa-0.68□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 GYPAP02724 150 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 FCER1GP30273 86 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RBP2P50120 134 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 S100A10P60903 97 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NREPQ16612 68 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 C14orf144Q96I85 54 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 MED14O60244 1454 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.69□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 KIF14Q15058 1648 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 LEAP2Q969E1 77 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.7□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 KIF21BO75037 1637 aa-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.71□□□□□ -2.52
WDR48-210ENST00000489838 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms