RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 BPY2O14599 106 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 HAMPP81172 84 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 Q5XG85 94 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 IGFL1Q6UW32 110 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.35□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 A0A1W2PNM2 257 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 SCXQ7RTU7 201 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.34□□□□□ -2.03
RARB-208ENST00000489694 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 UQCRQO14949 82 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 NDUFB1O75438 58 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 KRTAP10-1P60331 282 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 HERC2O95714 4834 aa2.33□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.32□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.32□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.32□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 SERP2Q8N6R1 65 aa2.32□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 A0A087WSZ3 146 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 A8MWP4 228 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 NDUFC1O43677 76 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 COX7CP15954 63 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 LIMD2Q9BT23 127 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 LYSTQ99698 3801 aa2.31□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.3□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 SPINK1P00995 79 aa2.3□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 PRR15Q8IV56 129 aa2.3□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 HCG22E2RYF7 251 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 H3BPC8 53 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 IGKV4-1P06312 121 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 MOBPQ13875 183 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 C5orf47Q569G3 176 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 KMT2AQ03164 3969 aa2.28□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 C8orf87E5RJ46 101 aa2.28□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 KLKP1Q107X0 134 aa2.28□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.28□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 OCR1Q9BZK8 76 aa2.28□□□□□ -2.04
RARB-208ENST00000489694 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 RYR1P21817 5038 aa2.27□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 A0A087WVE0 104 aa2.27□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.27□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 A0A1B0GVX0 72 aa2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 K7EQZ3 153 aa2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 TMEM258P61165 79 aa2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 CASC2Q6XLA1 102 aa2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 Q96NJ1 140 aa2.26□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 hDV103S1A0JD37 113 aa2.25□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 MP68P56378 58 aa2.25□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 Q5VSD8 79 aa2.25□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.25□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.24□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 CCDC179H3BU77 68 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 LINC00313P59037 77 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 C1orf195Q5TG92 126 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 Q8N9L7 120 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.23□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.22□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 A0A0G2JQZ4 141 aa2.22□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 A0A0U1RQV1 116 aa2.22□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 C20orf197Q8N268 126 aa2.22□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.22□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.21□□□□□ -2.05
RARB-208ENST00000489694 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 LCE1CQ5T751 118 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.21□□□□□ -2.06
RARB-208ENST00000489694 DNAH2Q9P225 4427 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms