RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 PDE6GP18545 87 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-217ENST00000489650 TEN1Q86WV5 123 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GV72 72 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 F8W1H4 67 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 MTURNQ8N3F0 131 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 CCKP06307 115 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRN-217ENST00000489650 A8MUU9 505 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRN-217ENST00000489650 VPS25Q9BRG1 176 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GW54 56 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 PRO0461Q9UI25 63 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PNM2 257 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 LCE2BO14633 110 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WSZ3 146 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZQT0 140 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-217ENST00000489650 DSCR10P59022 87 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GV90 55 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-217ENST00000489650 MT1FP04733 61 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-217ENST00000489650 FAM236CP0DP71 79 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-10P60014 251 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRN-217ENST00000489650 ETDBQ3ZM63 59 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRN-217ENST00000489650 SIGMAR1Q99720 223 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRN-217ENST00000489650 HRES1P13985 223 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00313P59037 77 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 NREPQ16612 68 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 J3KT08 172 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV4-1P06312 121 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRN-217ENST00000489650 UBL5Q9BZL1 73 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFB1O75438 58 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRN-217ENST00000489650 ACYP1P07311 99 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRN-217ENST00000489650 J3QR89 54 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRN-217ENST00000489650 BPY2O14599 106 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZVQ6 151 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00846Q9NV44 126 aa9□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 A8MWP4 228 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRN-217ENST00000489650 C8orf87E5RJ46 101 aa8.98□□□□□ -0.97
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PTPRN-217ENST00000489650 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 SPINK7P58062 85 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 CXCL6P80162 114 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 K7ERU9 68 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 K7EQZ3 153 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00643Q86TS7 51 aa8.83□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.82□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 hDV103S1A0JD37 113 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.78□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 Q8N9L7 120 aa8.78□□□□□ -1
PTPRN-217ENST00000489650 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 CASC2Q6XLA1 102 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 HCG22E2RYF7 251 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFS5O43920 106 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRN-217ENST00000489650 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRN-217ENST00000489650 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-217ENST00000489650 IMUPQ9GZP8 106 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRN-217ENST00000489650 NEBP20929 6669 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRN-217ENST00000489650 A0A087WVE0 104 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRN-217ENST00000489650 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRN-217ENST00000489650 MT-ATP8P03928 68 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRN-217ENST00000489650 SCGB1A1P11684 91 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRN-217ENST00000489650 UQCRQO14949 82 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRN-217ENST00000489650 Q5W150 140 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 A6NN06 94 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2-30P06310 120 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 ATOX1O00244 68 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRN-217ENST00000489650 MT1BP07438 61 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 MP68P56378 58 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.38□□□□□ -1.07
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