RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.09□□□□□ -1.11
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HDLBP-241ENST00000487169 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.06□□□□□ -1.12
HDLBP-241ENST00000487169 PANO1I0J062 215 aa8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-241ENST00000487169 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HDLBP-241ENST00000487169 Q1T7F1 81 aa8.03□□□□□ -1.12
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZR54 194 aa8.02□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 Q5VSD8 79 aa8.01□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.99□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 SPINK7P58062 85 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 M0R2T5 61 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.98□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 Q5W150 140 aa7.97□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.96□□□□□ -1.13
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GU33 70 aa7.96□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 CSAG1Q6PB30 78 aa7.94□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 PDZD2O15018 2839 aa7.93□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.91□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 VWFP04275 2813 aa7.91□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00483Q53H64 154 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087X002 238 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 TENM2Q9NT68 2774 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 Q5VV11 94 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 LCA10Q71F78 164 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 S4R3F8 94 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 A8MU10 97 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 Q75L30 129 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 R4GN34 69 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 DMAC1Q96GE9 116 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.74□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 AKAP9Q99996 3911 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-241ENST00000487169 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-241ENST00000487169 TGP01266 2768 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.65□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 LUZP6Q538Z0 58 aa7.65□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.63□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.63□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.62□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 M0QZ58 72 aa7.6□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 PRAC1Q96KF2 57 aa7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-241ENST00000487169 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HDLBP-241ENST00000487169 H3BS24 57 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-241ENST00000487169 A6NN06 94 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-241ENST00000487169 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-241ENST00000487169 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-241ENST00000487169 ROMO1P60602 79 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-241ENST00000487169 PLAC4Q8WY50 150 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-241ENST00000487169 A8MUU9 505 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-241ENST00000487169 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-241ENST00000487169 FBN3Q75N90 2809 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-241ENST00000487169 XP32Q5T750 250 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-241ENST00000487169 COL7A1Q02388 2944 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0A0MQY5 61 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-241ENST00000487169 ANK2Q01484 3957 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-241ENST00000487169 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-241ENST00000487169 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-241ENST00000487169 TPRXLQ17RH7 258 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-241ENST00000487169 TNP1P09430 55 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-241ENST00000487169 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GVY2 172 aa6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-8P60410 259 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-241ENST00000487169 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.9□□□□□ -1.31
HDLBP-241ENST00000487169 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-10P60014 251 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-241ENST00000487169 H0YAA0 97 aa6.84□□□□□ -1.32
HDLBP-241ENST00000487169 P0C880 135 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-241ENST00000487169 LYSTQ99698 3801 aa6.81□□□□□ -1.32
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFAF8A1L188 74 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-241ENST00000487169 PP632Q6XCG6 107 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-241ENST00000487169 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-241ENST00000487169 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-241ENST00000487169 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.65□□□□□ -1.35
HDLBP-241ENST00000487169 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-241ENST00000487169 KMT2AQ03164 3969 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-241ENST00000487169 DNHD1Q96M86 4753 aa6.57□□□□□ -1.36
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