RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q6ZRX8	168 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q8NDZ9	215 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1W2PNM2	257 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		H0Y9P7	68 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q8NAQ8	132 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679		K7EQZ3	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF861P	O60384	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPRR1A	P35321	89 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MYCBP2-208	ENST00000486679	C8orf87	E5RJ46	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	COA5	Q86WW8	74 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	STAB1	Q9NY15	2570 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANK2	Q01484	3957 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679		A8MWP4	228 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	RTL8C	O15255	209 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	MAST4	O15021	2626 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB4A	O15263	64 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	MOBP	Q13875	183 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A096LPF7	62 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC01554	Q52M75	96 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	PANO1	I0J062	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPRR1B	P22528	89 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGFL1	Q6UW32	110 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A087WSZ3	146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACYP2	P14621	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	HTN3	P15516	51 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC00313	P59037	77 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q5W150	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679		K7EIL1	84 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679		K7ERS5	55 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	UQCR11	O14957	56 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679	HRES1	P13985	223 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1B0GU69	56 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPINK7	P58062	85 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	PCOTH	Q58A44	107 aa		3	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	DMAC1	Q96GE9	116 aa		2.99	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	COL7A1	Q02388	2944 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC00483	Q53H64	154 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNHD1	Q96M86	4753 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGLV7-43	P04211	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	APLN	Q9ULZ1	77 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRLH	P81277	87 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.94	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q96NJ1	140 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		2.93	□□□□□ -1.94
MYCBP2-208	ENST00000486679	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		2.92	□□□□□ -1.94

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