RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.93□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.89□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZSA8 131 aa9.89□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.88□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.86□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5VV11 94 aa9.86□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.85□□□□□ -0.83
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPINK7P58062 85 aa9.83□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSAG1Q6PB30 78 aa9.81□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.81□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.8□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0A0MQY5 61 aa9.79□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087X002 238 aa9.79□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.78□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.78□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMAC1Q96GE9 116 aa9.78□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZR54 194 aa9.77□□□□□ -0.84
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00483Q53H64 154 aa9.77□□□□□ -0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDZD2O15018 2839 aa9.73□□□□□ -0.85
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VWFP04275 2813 aa9.69□□□□□ -0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5VSD8 79 aa9.67□□□□□ -0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCE6AA0A183 80 aa9.66□□□□□ -0.86
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 S4R3F8 94 aa9.61□□□□□ -0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TENM2Q9NT68 2774 aa9.59□□□□□ -0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0R2T5 61 aa9.57□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.57□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUBNO60494 3623 aa9.54□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGP01266 2768 aa9.54□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROMO1P60602 79 aa9.53□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.52□□□□□ -0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 R4GN34 69 aa9.51□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.5□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.47□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.47□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.47□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.46□□□□□ -0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.41□□□□□ -0.9
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.39□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MU10 97 aa9.37□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BSNQ9UPA5 3926 aa9.37□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.36□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0QZ58 72 aa9.35□□□□□ -0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFHX3Q15911 3703 aa9.32□□□□□ -0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.3□□□□□ -0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.29□□□□□ -0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A6NN06 94 aa9.28□□□□□ -0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.21□□□□□ -0.94
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.17□□□□□ -0.94
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MUU9 505 aa9.04□□□□□ -0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLAC4Q8WY50 150 aa9.04□□□□□ -0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBN3Q75N90 2809 aa9.03□□□□□ -0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.96□□□□□ -0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL7A1Q02388 2944 aa8.95□□□□□ -0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.91□□□□□ -0.98
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XP32Q5T750 250 aa8.81□□□□□ -1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.8□□□□□ -1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YAA0 97 aa8.7□□□□□ -1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS13CQ709C8 3753 aa8.69□□□□□ -1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GVY2 172 aa8.69□□□□□ -1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.68□□□□□ -1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNP1P09430 55 aa8.67□□□□□ -1.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P0C880 135 aa8.57□□□□□ -1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.55□□□□□ -1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PP632Q6XCG6 107 aa8.54□□□□□ -1.04
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP9Q99996 3911 aa8.51□□□□□ -1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPRXLQ17RH7 258 aa8.51□□□□□ -1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-8P60410 259 aa8.47□□□□□ -1.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-10P60014 251 aa8.29□□□□□ -1.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.22□□□□□ -1.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.21□□□□□ -1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.17□□□□□ -1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP12-2P59991 146 aa8.17□□□□□ -1.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP12-1P59990 96 aa8.03□□□□□ -1.12
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.98□□□□□ -1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT1HL1P0DM35 61 aa7.97□□□□□ -1.13
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.96□□□□□ -1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNHD1Q96M86 4753 aa7.93□□□□□ -1.14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.9□□□□□ -1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.89□□□□□ -1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.85□□□□□ -1.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.8□□□□□ -1.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.77□□□□□ -1.17
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