RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 Q5XG85 94 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZQT0 140 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 PDE6GP18545 87 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 CD164Q04900 197 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 Q6Q795 121 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 LINC00643Q86TS7 51 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 LINC00846Q9NV44 126 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.65□□□□□ -1.5
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GV72 72 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-206ENST00000474188 PCP4P48539 62 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-206ENST00000474188 Q6JHZ5 121 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-206ENST00000474188 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-206ENST00000474188 DSCR8Q96T75 97 aa5.63□□□□□ -1.51
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NISCH-206ENST00000474188 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.58□□□□□ -1.52
NISCH-206ENST00000474188 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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NISCH-206ENST00000474188 Q6ZVQ6 151 aa5.56□□□□□ -1.52
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NISCH-206ENST00000474188 LCE2BO14633 110 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-206ENST00000474188 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
NISCH-206ENST00000474188 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.54□□□□□ -1.52
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NISCH-206ENST00000474188 Q75L30 129 aa5.53□□□□□ -1.52
NISCH-206ENST00000474188 CXCL6P80162 114 aa5.52□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 IGFL1Q6UW32 110 aa5.52□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.51□□□□□ -1.53
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NISCH-206ENST00000474188 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 F8WEM9 126 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 MT1FP04733 61 aa5.5□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.49□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.49□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.49□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 A0A087WVE0 104 aa5.47□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 NREPQ16612 68 aa5.47□□□□□ -1.53
NISCH-206ENST00000474188 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 A8MUU9 505 aa5.45□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 Q96NJ1 140 aa5.45□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 ATOX1O00244 68 aa5.44□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 IGKV4-1P06312 121 aa5.44□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 BPY2O14599 106 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 DSCR10P59022 87 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 A0A087WSZ3 146 aa5.41□□□□□ -1.54
NISCH-206ENST00000474188 CCDC179H3BU77 68 aa5.4□□□□□ -1.54
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NISCH-206ENST00000474188 SERP2Q8N6R1 65 aa5.38□□□□□ -1.55
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NISCH-206ENST00000474188 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.37□□□□□ -1.55
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NISCH-206ENST00000474188 K7EQZ3 153 aa5.35□□□□□ -1.55
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP10-10P60014 251 aa5.35□□□□□ -1.55
NISCH-206ENST00000474188 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-206ENST00000474188 J3KT08 172 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 OCR1Q9BZK8 76 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 A8MWP4 228 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 PRR15Q8IV56 129 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 HCG22E2RYF7 251 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.28□□□□□ -1.56
NISCH-206ENST00000474188 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 FAM236CP0DP71 79 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 NEBP20929 6669 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 KLKP1Q107X0 134 aa5.26□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 LINC00313P59037 77 aa5.25□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GVX0 72 aa5.23□□□□□ -1.57
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NISCH-206ENST00000474188 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.23□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 C20orf197Q8N268 126 aa5.23□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.23□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 CASC2Q6XLA1 102 aa5.22□□□□□ -1.57
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.21□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.21□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.21□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 H7BZZ5 65 aa5.2□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.2□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 hDV103S1A0JD37 113 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 TMEM258P61165 79 aa5.18□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 C5orf47Q569G3 176 aa5.18□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.17□□□□□ -1.58
NISCH-206ENST00000474188 NDUFC1O43677 76 aa5.17□□□□□ -1.58
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