RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSMD4-208	ENST00000462970	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSMD4-208	ENST00000462970	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSMD4-208	ENST00000462970	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		Q6ZQT0	140 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		K7EP34	96 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		H3BT86	120 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	PDE6G	P18545	87 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00313	P59037	77 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		Q75L30	129 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		J3KT08	172 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		J3QR89	54 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A1B0GVX0	72 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970		A8MUU9	505 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	NDUFB1	O75438	58 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	NREP	Q16612	68 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A1B0GW54	56 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	C8orf87	E5RJ46	101 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970		F8W1H4	67 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970		A8MWP4	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	BPY2	O14599	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970		Q6ZVQ6	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970		K7EQZ3	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD4-208	ENST00000462970		M0R2T5	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	NDUFS5	O43920	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	MT1H	P80294	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970		Q8N9L7	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMD4-208	ENST00000462970	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	SPINK7	P58062	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	HRES1	P13985	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMD4-208	ENST00000462970	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	CXCL6	P80162	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	ACYP1	P07311	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970		Q5W150	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSMD4-208	ENST00000462970	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A087WVE0	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	MT2A	P02795	61 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMD4-208	ENST00000462970	UQCRQ	O14949	82 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMD4-208	ENST00000462970		H0Y9P7	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMD4-208	ENST00000462970	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms