RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSPOA2VEC9 5147 aa4.28□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.28□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEN1Q86WV5 123 aa4.28□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087WSZ3 146 aa4.27□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.27□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 USH2AO75445 5202 aa4.27□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0B4J2C4 111 aa4.26□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PNM2 257 aa4.26□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSCR10P59022 87 aa4.26□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 BATFQ16520 125 aa4.26□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIGD1BQ9P298 99 aa4.26□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT2AP02795 61 aa4.25□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.25□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.24□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YGX0 51 aa4.24□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.24□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.24□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9JAW5 83 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BMG7 143 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT1FP04733 61 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRES1P13985 223 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD52Q0P140 79 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMAIP1Q13794 54 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB37Q96AX2 223 aa4.23□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXYD2P54710 66 aa4.22□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA45Q537H7 98 aa4.22□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.22□□□□□ -1.73
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEND1Q8N111 149 aa4.21□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf118A6NHY6 69 aa4.2□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.2□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.2□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.19□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 FABP2P12104 132 aa4.19□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00313P59037 77 aa4.19□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.18□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.18□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV4-1P06312 121 aa4.18□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM236CP0DP71 79 aa4.18□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.18□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNCGO76070 127 aa4.17□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAMP8Q9BV40 100 aa4.17□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.16□□□□□ -1.74
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7ERJ3 54 aa4.15□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.15□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.13□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCKP06307 115 aa4.13□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZVQ6 151 aa4.13□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GVX0 72 aa4.12□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRACP01848 142 aa4.12□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP10-10P60014 251 aa4.12□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.12□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.11□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAL4O96015 105 aa4.11□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf87E5RJ46 101 aa4.1□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BQ85 93 aa4.1□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.1□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMB2P49721 201 aa4.09□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.09□□□□□ -1.75
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.08□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPINK7P58062 85 aa4.07□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 IMUPQ9GZP8 106 aa4.07□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC179H3BU77 68 aa4.06□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX6CP09669 75 aa4.06□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM258P61165 79 aa4.06□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00846Q9NV44 126 aa4.06□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZQT0 140 aa4.05□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR15Q8IV56 129 aa4.05□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EP34 96 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCRQO14949 82 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSCR8Q96T75 97 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.03□□□□□ -1.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.02□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8W1H4 67 aa4.02□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFS5O43920 106 aa4.02□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 A8MWP4 228 aa4.01□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAX1BP3O14907 124 aa4.01□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.99□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.98□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSPHP1O15172 72 aa3.98□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFB1O75438 58 aa3.98□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.98□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.97□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.97□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.97□□□□□ -1.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GW54 56 aa3.96□□□□□ -1.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.96□□□□□ -1.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.96□□□□□ -1.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT-ATP8P03928 68 aa3.95□□□□□ -1.78
GAPDHP28-201ENST00000455134 MP68P56378 58 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 188.3 ms