RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFC1O43677 76 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.42□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM236CP0DP71 79 aa5.42□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.42□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.42□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLKP1Q107X0 134 aa5.41□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 RYR1P21817 5038 aa5.4□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.4□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N9L7 120 aa5.4□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.4□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.4□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MWP4 228 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7EQZ3 153 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK1P00995 79 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 OCR1Q9BZK8 76 aa5.39□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.38□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCG22E2RYF7 251 aa5.38□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR15Q8IV56 129 aa5.38□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N1X5 172 aa5.38□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 C20orf197Q8N268 126 aa5.38□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 H7BZZ5 65 aa5.37□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 OXTP01178 125 aa5.37□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q5VSD8 79 aa5.37□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q96NJ1 140 aa5.37□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFB1O75438 58 aa5.36□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 LIMD2Q9BT23 127 aa5.36□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRO0628Q9UI54 55 aa5.36□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 C4orf26Q17RF5 130 aa5.35□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.35□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.35□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.33□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-8P60410 259 aa5.32□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.32□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.32□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.31□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASC2Q6XLA1 102 aa5.31□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.3□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf195Q5TG92 126 aa5.3□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0U1RQV1 116 aa5.29□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GVX0 72 aa5.29□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BPC8 53 aa5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNXBP22105 4242 aa5.28□□□□□ -1.56
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.27□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 hDV103S1A0JD37 113 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 C8orf87E5RJ46 101 aa5.26□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 MP68P56378 58 aa5.25□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE4AQ5TA78 99 aa5.25□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNURFQ9Y675 71 aa5.25□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE1DQ5T752 114 aa5.23□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.22□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00313P59037 77 aa5.21□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.2□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT1HL1P0DM35 61 aa5.2□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 H0Y9P7 68 aa5.19□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.18□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00208Q96KT6 92 aa5.16□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERC2O95714 4834 aa5.15□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.15□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 BRK1Q8WUW1 75 aa5.15□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.15□□□□□ -1.58
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q1T7F1 81 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 V9GYY9 64 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYCBP2O75592 4640 aa5.14□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.13□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.13□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFS5O43920 106 aa5.13□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.11□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.11□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.1□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.09□□□□□ -1.59
CCNDBP1-202ENST00000444658 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.08□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.07□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MUU9 505 aa5.07□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.07□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEC61GP60059 68 aa5.05□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q5W150 140 aa5.05□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q75L30 129 aa5.05□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.04□□□□□ -1.6
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