RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZSA8 131 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-202ENST00000426333 HIVEP1P15822 2718 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TNP2Q05952 138 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR1AP35321 89 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 Q5XG85 94 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00483Q53H64 154 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAC1Q96KF2 57 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CSAG1Q6PB30 78 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 DMAC1Q96GE9 116 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 Q8NDZ9 215 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRR1BP22528 89 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 Q5VV11 94 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 Q5W150 140 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-202ENST00000426333 SPINK7P58062 85 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R2T5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0A0MQY5 61 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BS24 57 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 R4GN34 69 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 S4R3F8 94 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 LYSTQ99698 3801 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-202ENST00000426333 TENM3Q9P273 2699 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-202ENST00000426333 OXTP01178 125 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.59□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DNHD1Q96M86 4753 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ROMO1P60602 79 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-202ENST00000426333 COL7A1Q02388 2944 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZR54 194 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 M0QZ58 72 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-1P60331 282 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 Q5VSD8 79 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP10-2P60368 255 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PANO1I0J062 215 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.4□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087X002 238 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PLAC4Q8WY50 150 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 LCE6AA0A183 80 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-202ENST00000426333 KMT2AQ03164 3969 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NN06 94 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH2Q9P225 4427 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MU10 97 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TENM2Q9NT68 2774 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MUU9 505 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.21□□□□□ -1.41
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFAF8A1L188 74 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-202ENST00000426333 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.15□□□□□ -1.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FBN3Q75N90 2809 aa6.15□□□□□ -1.43
EFTUD2-202ENST00000426333 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-202ENST00000426333 TGP01266 2768 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-202ENST00000426333 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 TNP1P09430 55 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD1P98161 4303 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-202ENST00000426333 SACSQ9NZJ4 4579 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms