RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422847.1

LINC00857-201, long intergenic non-protein coding RNA 857, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00857, Length 2,161 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00857-201ENST00000422847 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.93□□□□□ -1.3
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LINC00857-201ENST00000422847 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00857-201ENST00000422847 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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LINC00857-201ENST00000422847 PRAC1Q96KF2 57 aa6.88□□□□□ -1.31
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LINC00857-201ENST00000422847 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00857-201ENST00000422847 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.85□□□□□ -1.31
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LINC00857-201ENST00000422847 CHTF8P0CG12 524 aa6.82□□□□□ -1.32
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LINC00857-201ENST00000422847 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.42□□□□□ -1.38
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LINC00857-201ENST00000422847 CSAG1Q6PB30 78 aa6.35□□□□□ -1.39
LINC00857-201ENST00000422847 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LINC00857-201ENST00000422847 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00857-201ENST00000422847 RYR1P21817 5038 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00857-201ENST00000422847 HSPG2P98160 4391 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.33□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.32□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.31□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 FAT1Q14517 4588 aa6.3□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.28□□□□□ -1.4
LINC00857-201ENST00000422847 LUZP6Q538Z0 58 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00857-201ENST00000422847 Q8N1X5 172 aa6.26□□□□□ -1.41
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