RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 V9GYY9 64 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-2P60368 255 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PKHD1P08F94 4074 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVX0 72 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf195Q5TG92 126 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK2AP2O75956 126 aa11.14□□□□□ -0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 CD164Q04900 197 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 Q5VV11 94 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-202ENST00000417536 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.04□□□□□ -0.64
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SH3BP1-202ENST00000417536 LCA10Q71F78 164 aa10.86□□□□□ -0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.84□□□□□ -0.67
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SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZSA8 131 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVY2 172 aa10.59□□□□□ -0.71
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.55□□□□□ -0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GU69 56 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.48□□□□□ -0.73
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SH3BP1-202ENST00000417536 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK1P00995 79 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPG2P98160 4391 aa10.4□□□□□ -0.74
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SH3BP1-202ENST00000417536 RYR1P21817 5038 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf92A6NGG3 77 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAC1Q96KF2 57 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 Q5VSD8 79 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TNXBP22105 4242 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MUU9 505 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.04□□□□□ -0.8
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