RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.94□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.94□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HERC2O95714 4834 aa3.94□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP10-1P60331 282 aa3.93□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC01554Q52M75 96 aa3.93□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.93□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGLV6-57P01721 117 aa3.93□□□□□ -1.78
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.93□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.92□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSPG2P98160 4391 aa3.92□□□□□ -1.78
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAL4O96015 105 aa3.91□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.91□□□□□ -1.78
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.9□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCXQ7RTU7 201 aa3.9□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNURFQ9Y675 71 aa3.9□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAT1Q14517 4588 aa3.9□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H0YGX0 51 aa3.9□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRLHP81277 87 aa3.9□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.9□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.89□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.89□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf137Q5JT78 98 aa3.89□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MU10 97 aa3.88□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.88□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.88□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.87□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 hDV103S1A0JD37 113 aa3.87□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.87□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00575Q6W349 94 aa3.86□□□□□ -1.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZQY7 126 aa3.86□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.85□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.85□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERC2-IT1O76042 136 aa3.84□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.84□□□□□ -1.79
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPRR1AP35321 89 aa3.83□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYCBP2O75592 4640 aa3.83□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HERC1Q15751 4861 aa3.82□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGLV7-43P04211 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.81□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.79□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.78□□□□□ -1.8
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MOBPQ13875 183 aa3.78□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIMD2Q9BT23 127 aa3.78□□□□□ -1.81
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.77□□□□□ -1.81
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.76□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.76□□□□□ -1.81
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPRR4Q96PI1 79 aa3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBL5Q9BZL1 73 aa3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q5VSD8 79 aa3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.75□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MWP4 228 aa3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NED7 52 aa3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.72□□□□□ -1.81
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.71□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR15LQ9BU68 103 aa3.71□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.7□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGFL1Q6UW32 110 aa3.7□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZQT0 140 aa3.7□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPRR1BP22528 89 aa3.7□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q5W150 140 aa3.7□□□□□ -1.82
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASC2Q6XLA1 102 aa3.7□□□□□ -1.82
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