RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 A6NED7 52 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 REG3GQ6UW15 175 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 SPRR1AP35321 89 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 H3BPC8 53 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRX8 168 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 H0Y9P7 68 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 MOBPQ13875 183 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 COA5Q86WW8 74 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 H0Y9J4 135 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS3-201ENST00000318129 HSPG2P98160 4391 aa6.21□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 MYCBP2O75592 4640 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 C8orf87E5RJ46 101 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 A0A0G2JQZ4 141 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 PRLHP81277 87 aa6.17□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 CASC2Q6XLA1 102 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 IGFL1Q6UW32 110 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 IGLV7-43P04211 117 aa6.15□□□□□ -1.42
GINS3-201ENST00000318129 ZNF861PO60384 105 aa6.15□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 RYR1P21817 5038 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WSZ3 146 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 CDK2AP2O75956 126 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 SPINK7P58062 85 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.11□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 A8MWP4 228 aa6.1□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 LINC00313P59037 77 aa6.1□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.09□□□□□ -1.43
GINS3-201ENST00000318129 SPRR1BP22528 89 aa6.08□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 FAM229AH3BQW9 127 aa6.08□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 PCOTHQ58A44 107 aa6.07□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.07□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.07□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 PRAC1Q96KF2 57 aa6.06□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.06□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.06□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 LINC00483Q53H64 154 aa6.05□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.05□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 HRES1P13985 223 aa6.05□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 H3BS24 57 aa6.04□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 LINC01554Q52M75 96 aa6.03□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.44
GINS3-201ENST00000318129 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.01□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 Q5VSD8 79 aa6□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 HERC2O95714 4834 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 Q8N1X5 172 aa5.99□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.98□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.97□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.97□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.96□□□□□ -1.45
GINS3-201ENST00000318129 A0A087X002 238 aa5.96□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.96□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.95□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 HERC1Q15751 4861 aa5.94□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.92□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 Q96NJ1 140 aa5.92□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.92□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.91□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.91□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.9□□□□□ -1.46
GINS3-201ENST00000318129 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.9□□□□□ -1.47
GINS3-201ENST00000318129 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GINS3-201ENST00000318129 TNXBP22105 4242 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS3-201ENST00000318129 ACYP2P14621 99 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GVX0 72 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS3-201ENST00000318129 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.85□□□□□ -1.47
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GINS3-201ENST00000318129 CSAG1Q6PB30 78 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 SPINK1P00995 79 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP10-8P60410 259 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 Q5W150 140 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS3-201ENST00000318129 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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