RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.6□□□□□ -1.51
CUX1-201ENST00000292535 Q5XG85 94 aa5.59□□□□□ -1.51
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZR54 194 aa5.59□□□□□ -1.52
CUX1-201ENST00000292535 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CUX1-201ENST00000292535 EYSQ5T1H1 3165 aa5.58□□□□□ -1.52
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CUX1-201ENST00000292535 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.48□□□□□ -1.69
CUX1-201ENST00000292535 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
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