RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 NOTCH1P46531 2555 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 TENM4Q6N022 2769 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 DMAC1Q96GE9 116 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 PRAC1Q96KF2 57 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 H3BS24 57 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC3-201ENST00000264345 A0A087X002 238 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 STAB1Q9NY15 2570 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-2P60368 255 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-1P60331 282 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 CRIPTQ9P021 101 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 SPINK7P58062 85 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 LINC01554Q52M75 96 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 Q8N1X5 172 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 COL6A5A8TX70 2615 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
HERC3-201ENST00000264345 A0A0D9SG42 100 aa5.09□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 TENM3Q9P273 2699 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZSA8 131 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 C9orf92A6NGG3 77 aa5.05□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 VWFP04275 2813 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 A6NN06 94 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 CSAG1Q6PB30 78 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-201ENST00000264345 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GU33 70 aa4.96□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.96□□□□□ -1.61
HERC3-201ENST00000264345 A8MU10 97 aa4.95□□□□□ -1.62
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-201ENST00000264345 CUBNO60494 3623 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-201ENST00000264345 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-201ENST00000264345 A8MUU9 505 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-201ENST00000264345 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 LUZP6Q538Z0 58 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-201ENST00000264345 S4R3F8 94 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 Q5VSD8 79 aa4.78□□□□□ -1.64
HERC3-201ENST00000264345 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.75□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 ROMO1P60602 79 aa4.74□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A0MQY5 61 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GVY2 172 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.72□□□□□ -1.65
HERC3-201ENST00000264345 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 ANK2Q01484 3957 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 H0YAA0 97 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 J3QL48 77 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF8A1L188 74 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-201ENST00000264345 R4GN34 69 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 XP32Q5T750 250 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-8P60410 259 aa4.61□□□□□ -1.67
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HERC3-201ENST00000264345 TENM2Q9NT68 2774 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-201ENST00000264345 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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HERC3-201ENST00000264345 TGP01266 2768 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 DNAH2Q9P225 4427 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 TPRXLQ17RH7 258 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-201ENST00000264345 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-201ENST00000264345 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-201ENST00000264345 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-201ENST00000264345 M0R2T5 61 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-201ENST00000264345 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.46□□□□□ -1.69
HERC3-201ENST00000264345 FBN3Q75N90 2809 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 COL7A1Q02388 2944 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 PLAC4Q8WY50 150 aa4.43□□□□□ -1.7
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